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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】恳求：castep吸附的位置问题
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nright

铜虫 (小有名气)

考虑一下对称性的问题

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢，欢迎常来 5-15 00:06
原子吸附在不同的位置，表面模型（超晶胞）会有不同的对称性，计算时给晶胞加上对称性，计算过程中，所吸附的原子或分子不会突破对称性的限制，跑到另一个吸附位置上。如果不加对称性，用P1去计算，当然会出现你所遇到的情况。我猜你的吸附体系不会是在不同的吸附位置有相同的对称性吧？
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11楼2009-05-15 11:38:01
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cmyy1988

金虫 (小有名气)
哦，终于等到了，好珍贵的建议。是 ，我没有考虑对称性，请恕我愚笨，在初始模型做好后，怎么才能使他们的对称性不同，望赐教，真的很感激
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12楼2009-05-15 16:55:47
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archhector

引用回帖:
Originally posted by cmyy1988 at 2009-5-15 16:55:
哦，终于等到了，好珍贵的建议。是 ，我没有考虑对称性，请恕我愚笨，在初始模型做好后，怎么才能使他们的对称性不同，望赐教，真的很感激

一般用Supercell吧
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13楼2009-05-15 17:06:32
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archhector

★
zdhlover(金币+1,VIP+0):谢谢，欢迎常来 5-15 00:06
引用回帖:
Originally posted by chimegreen at 2009-5-13 11:03:
另外castep做表面是有问题的
好像文献里提到过不太准
具体我没有那篇文献
你再调研一下

castep做表面是没有大问题的，不过要先求最小层面厚度，这样可以让上下两个表面的相互作用忽略不计。
First principles simulations of Cu and Au deposition on α-Al2O3 (0 0 0 1) surface,
Applied Surface Science (2004) 228–232
我做表面吸附照着这个学的，另外如果是磁性体系一定要勾选自旋体系。
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14楼2009-05-15 17:12:07
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nright

铜虫 (小有名气)

加对称性

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):谢谢，欢迎常来 5-15 00:06
建好表面吸附模型后, 点击build菜单, 在下拉菜单里找Symmetry, 然后Find Symmetry, impose Symmetry. 对加了对称性的超晶胞模型, 做CASTEP计算
引用回帖:
Originally posted by nright at 2009-5-15 11:38:
原子吸附在不同的位置，表面模型（超晶胞）会有不同的对称性，计算时给晶胞加上对称性，计算过程中，所吸附的原子或分子不会突破对称性的限制，跑到另一个吸附位置上。如果不加对称性，用P1去计算，当然会出现你所 ...

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15楼2009-05-15 17:51:27
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positron

木虫 (职业作家)
热心啊

看到你解释的“突破对称性限制”，能具体解释一下么，或者补习那一块知识才能知道

呵呵，谢谢
引用回帖:
Originally posted by nright at 2009-5-15 17:51:
建好表面吸附模型后, 点击build菜单, 在下拉菜单里找Symmetry, 然后Find Symmetry, impose Symmetry. 对加了对称性的超晶胞模型, 做CASTEP计算
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16楼2009-05-15 18:19:44
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cmyy1988

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by nright at 2009-5-15 17:51:
建好表面吸附模型后, 点击build菜单, 在下拉菜单里找Symmetry, 然后Find Symmetry, impose Symmetry. 对加了对称性的超晶胞模型, 做CASTEP计算


谢谢师兄指教，但是我打开后，impose symmetry是灰色的，不可执行，这是何故？恳请指教。
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17楼2009-05-16 11:28:58
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cmyy1988

金虫 (小有名气)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流！ 5-16 20:30
我是先做了表面，这时表面是有对称性的，后来我把被吸附物粘贴到3D里，移动到表面上，对称性就是P1了，而且死活也改不了，我知道我肯定做错了，麻烦您告诉我哪出粗了嘛
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18楼2009-05-16 12:01:41
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nright

铜虫 (小有名气)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流！ 5-16 20:30
先要找到对称性, Find symmetry, 找到对称性后, 才能impose symmetry.
引用回帖:
Originally posted by cmyy1988 at 2009-5-16 11:28:

谢谢师兄指教，但是我打开后，impose symmetry是灰色的，不可执行，这是何故？恳请指教。

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19楼2009-05-16 17:57:50
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