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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 转录组测序结果拿到后一般都有哪些分析套路啊？
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xzq8417

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fengliuku at 2018-09-26 14:35:21
看论文

什么论文，能推荐一下吗

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11楼2019-08-06 21:05:30
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xzq8417

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by fengliuku at 2018-09-26 14:35:21
看论文

什么论文，能推荐一下吗

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12楼2019-08-06 21:05:55
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合欢花的忧伤

新虫 (著名写手)
看论文，都有的

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13楼2019-08-07 00:30:18
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moyunzhi

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 酱油托儿所 at 2019-02-25 11:42:09
楼主的需求是哪些，把需求说出来我这边可以给一些方法和参考

有段时间没有看小木虫了，首先感谢帮助！不知道阁下是否还能看到。这个分析后来没有做了。不过还是想请教一下，以后可能还会再做。
其实最开始我们将转录组送去测序，公司返还给我们的是所有上下调的基因的表格。这些表格我自己通过一些在线软件聚类了一下，从不同类别中根据我们的样本联系从中挑了几个基因，然后就直接构建marker,过表达和crispr相关转基因材料了吗？
其实我一开始想请教的就是拿到公司返还给我们的结果，只有上下调的基因表格的话，现有的套路中一般可以从哪些方面或者角度入手，是只有从聚类分析展开吗？
我自己看文献，基本上都是这种套路。不知道是不是我看的太少了。所以太狭隘了？
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14楼2019-09-10 18:57:58
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moyunzhi

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
10楼: Originally posted by 合欢花的忧伤 at 2019-08-05 08:26:18
很多的

谢谢回复。我之前没有做过相关的分析，我们实验室也才刚开始接触这个转录组分析。
所以当时就想请教一下转录组分析是怎么展开的。
前期的分析，公司做了，给我们的只有上下调的基因的表格。从这个开始出发的话，除了聚类这种分析外，还有其它方法吗？
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15楼2019-09-10 19:02:45
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