| 查看: 6317 | 回复: 14 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
liyongxiu木虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】计算电子密度图【已解决】 已有2人参与
|
|||
|
请问谁告诉下怎么计算分子电子密度图及电子密度差图哦，折磨了四五天了555555，先谢谢各位了 呵呵，我已经画好，若其它虫虫有其他好的方法希望能继续分享，讨论。 我的如下：用guassview和guassian画，就是我们用复合物总电子密度的cube文件减去两个单体的（用cubeman程序）。用guassview打开最后生成的cube文件。cube文件生成步骤: chk---fch--cube。所有程序都我都在guassian 的utilities菜单兰下算的。望对大家有用。但是，电子密度差图怎么分析呢？不是很懂。 [ Last edited by cadick on 2009-12-11 at 02:32 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 实验数据作图 |
» 猜你喜欢
基金申请
已经有44人回复
-
CSC与新西兰维多利亚大学PhD奖学金项目
已经有0人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有79人回复
-
新西兰Robinson研究所 招聘CSC公派访问人员
已经有0人回复
-
帮我的英语口语老师找学生
已经有0人回复
-
什么时候开奖？
已经有13人回复
-
散金币祈福
已经有94人回复
-
青基已中
已经有1人回复
-
散金币祈福
已经有112人回复
-
求助，如何提取ELK的rt-TDDFT在某一时刻的自旋密度分布和电子密度分布
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 从He2等的量子化学图形解读范德华作用
已经有43人回复
- CASTEP计算差分电子密度图
已经有7人回复
- 怎么画电子密度图的等高线
已经有3人回复
- 如何做电子密度差分图
已经有16人回复
- 【求助】CASTEP计算的电子密度的单位？
已经有17人回复
- 【求助】求助哪位大侠帮我分析下电子密度差分图
已经有16人回复
- 【求助】电子态密度计算dos图中feimi能级的确定
已经有7人回复
- 【求助】VASP计算电子态密度
已经有34人回复
- 【求助】Dmol3计算outmol分析电子密度，谢谢！
已经有11人回复
- 【zhou2009个人文集】极性键电子密度差Δρ的解析
已经有15人回复
- 【zhou2009个人文集】电子密度ρ和密度差Δρ
已经有38人回复
medicine1031
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1129.5
- 红花: 1
- 帖子: 175
- 在线: 11.2小时
- 虫号: 452162
- 注册: 2007-11-05
- 专业: 高分子材料的加工与成型
9楼2009-06-23 09:30:19
wenmenkui
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 907.3
- 散金: 50
- 帖子: 437
- 在线: 35.6小时
- 虫号: 622104
- 注册: 2008-10-10
- 专业: 理论和计算化学
2楼2009-05-25 20:55:20
zhaohscas1976
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 792.9
- 散金: 6
- 红花: 4
- 帖子: 135
- 在线: 54.7小时
- 虫号: 553808
- 注册: 2008-05-05
- 性别: GG
- 专业: 半导体材料
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
q68(金币+2,VIP+0):很好的讨论！ 5-26 15:38
zeoliters(金币+2,VIP+0):感谢分享！ 5-26 13:07
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
q68(金币+2,VIP+0):很好的讨论！ 5-26 15:38
zeoliters(金币+2,VIP+0):感谢分享！ 5-26 13:07
|
首先，你要指明你用的是什么计算工具，不同的计算工具的后处理工具的能力也有很大的不同。 比如vasp，就有lev00可以比较好的处理电荷密度的问题，另外lev00的作者说明该工具也可以处理castep的电荷密度，但该工具对于较高的castep版本并不没有多少更新。 下面我以castep的情况为例，说明如下：总的来说，如果你要得到高质量的图的话，还是比较复杂的。我分述如下： 1- 我所说的高质量的图是指导出相应的数据文件，然后自己编程或用工具软件处理得到矢量图，而不是用material studio的gui界面出图。 2- 对于电荷密度图，material studio 可以直接导出相应的数据文件。对于电荷密度差图，material studio 并不能直接导出相应的数据文件，但是可以使用剑桥大学的 Michael Rutter 博士开发的 check2sxf 来提取得到电荷密度差数据。 3- 上面所说的电荷密度或电荷密度差的数据文件，都是三维网格数据格式的，而一般情况下，我们感兴趣的是某个晶面上的点和密度（差）的分布情况。故仍需要对上面的数据做插值或抽取处理。 在工具上可以使用origin或matlab或tecplot来完成。当然，比较高级的方法是用fortran编程来完成。 4- 最难处理的情况是获得三斜晶格的某个晶面上的点和密度（差）分布，除此情况之外，其他的都比较容易获取。 暂时说到这里，看大家的反应再进一步讨论。 |
3楼2009-05-26 12:04:32
liyongxiu
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1874.2
- 散金: 335
- 红花: 1
- 帖子: 384
- 在线: 136.6小时
- 虫号: 442131
- 注册: 2007-10-27
- 专业: 化学动力学
5楼2009-06-09 09:05:50
