24小时热门版块排行榜    

查看: 1832  |  回复: 25

hclwonder

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
20楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2018-07-08 13:52:20
谢谢。。是不是我要找的目的蛋白,搜到之后,点开看他有没有配体?还是说我搜目的蛋白的时候直接筛选抗原抗体的结合物?
...

点开看它是不是与抗体结合的。与抗体结合的那部分残基差不多就是抗原决定簇了。

发自小木虫Android客户端
21楼2018-07-08 19:27:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
21楼: Originally posted by hclwonder at 2018-07-08 19:27:19
点开看它是不是与抗体结合的。与抗体结合的那部分残基差不多就是抗原决定簇了。
...

谢谢,我查到我那个目的蛋白了,但是配体那栏,不管设置球形或棒行,都没有。而且在ligand view选项,显示no ligands to view the structure。这样子是应该不知道了。我听有的人说,可以用专门的预测软件像是IEDB的 tb cell epitope prediction tools...

发自小木虫Android客户端
我就是我,是颜色不一样的焰火
22楼2018-07-08 19:41:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
22楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2018-07-08 19:41:12
谢谢,我查到我那个目的蛋白了,但是配体那栏,不管设置球形或棒行,都没有。而且在ligand view选项,显示no ligands to view the structure。这样子是应该不知道了。我听有的人说,可以用专门的预测软件像是IEDB的 ...

抗体也是蛋白,是不会显示为配体的。
预测的方法是有,我没怎么用过,但估计准确性不会很好。

发自小木虫Android客户端
23楼2018-07-08 20:30:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
23楼: Originally posted by hclwonder at 2018-07-08 20:30:48
抗体也是蛋白,是不会显示为配体的。
预测的方法是有,我没怎么用过,但估计准确性不会很好。
...

哦哦,原来如此,我就应该在搜完之后看看是不是与抗体结合了。多谢

发自小木虫Android客户端
我就是我,是颜色不一样的焰火
24楼2018-07-08 20:51:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
21楼: Originally posted by hclwonder at 2018-07-08 19:27:19
点开看它是不是与抗体结合的。与抗体结合的那部分残基差不多就是抗原决定簇了。
...

另外我再请教一下,我搜了蛋白质后,有两栏分别是sequence similarity和structure similarity,这个序列相似性和结构相似性是要说明什么?也没有别的蛋白和他比较啊,请问这块你知道么?谢谢

发自小木虫Android客户端
我就是我,是颜色不一样的焰火
25楼2018-07-08 21:04:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
25楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2018-07-08 21:04:20
另外我再请教一下,我搜了蛋白质后,有两栏分别是sequence similarity和structure similarity,这个序列相似性和结构相似性是要说明什么?也没有别的蛋白和他比较啊,请问这块你知道么?谢谢
...

就是顾名思义了,从序列和结构两个角度比较similarity。它是跟其它蛋白比较的。

发自小木虫Android客户端
26楼2018-07-08 22:41:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 齐国小药童 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 296求调剂 +5 大口吃饭 身体健 2026-03-13 5/250 2026-03-17 21:05 by 不惑可乐
[考研] 293求调剂 +7 zjl的号 2026-03-16 12/600 2026-03-17 18:22 by 重科小霸王
[考研] 304求调剂 +8 小熊joy 2026-03-14 8/400 2026-03-17 17:29 by ruiyingmiao
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:27 by Little-xue
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 321求调剂 +5 大米饭! 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 工科,求调剂 +3 我887 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123! 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见