24小时热门版块排行榜    

查看: 2157  |  回复: 25

hclwonder

新虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
20楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2018-07-08 13:52:20
谢谢。。是不是我要找的目的蛋白,搜到之后,点开看他有没有配体?还是说我搜目的蛋白的时候直接筛选抗原抗体的结合物?
...

点开看它是不是与抗体结合的。与抗体结合的那部分残基差不多就是抗原决定簇了。

发自小木虫Android客户端
21楼2018-07-08 19:27:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
21楼: Originally posted by hclwonder at 2018-07-08 19:27:19
点开看它是不是与抗体结合的。与抗体结合的那部分残基差不多就是抗原决定簇了。
...

谢谢,我查到我那个目的蛋白了,但是配体那栏,不管设置球形或棒行,都没有。而且在ligand view选项,显示no ligands to view the structure。这样子是应该不知道了。我听有的人说,可以用专门的预测软件像是IEDB的 tb cell epitope prediction tools...

发自小木虫Android客户端
我就是我,是颜色不一样的焰火
22楼2018-07-08 19:41:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
22楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2018-07-08 19:41:12
谢谢,我查到我那个目的蛋白了,但是配体那栏,不管设置球形或棒行,都没有。而且在ligand view选项,显示no ligands to view the structure。这样子是应该不知道了。我听有的人说,可以用专门的预测软件像是IEDB的 ...

抗体也是蛋白,是不会显示为配体的。
预测的方法是有,我没怎么用过,但估计准确性不会很好。

发自小木虫Android客户端
23楼2018-07-08 20:30:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
23楼: Originally posted by hclwonder at 2018-07-08 20:30:48
抗体也是蛋白,是不会显示为配体的。
预测的方法是有,我没怎么用过,但估计准确性不会很好。
...

哦哦,原来如此,我就应该在搜完之后看看是不是与抗体结合了。多谢

发自小木虫Android客户端
我就是我,是颜色不一样的焰火
24楼2018-07-08 20:51:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
21楼: Originally posted by hclwonder at 2018-07-08 19:27:19
点开看它是不是与抗体结合的。与抗体结合的那部分残基差不多就是抗原决定簇了。
...

另外我再请教一下,我搜了蛋白质后,有两栏分别是sequence similarity和structure similarity,这个序列相似性和结构相似性是要说明什么?也没有别的蛋白和他比较啊,请问这块你知道么?谢谢

发自小木虫Android客户端
我就是我,是颜色不一样的焰火
25楼2018-07-08 21:04:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
25楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2018-07-08 21:04:20
另外我再请教一下,我搜了蛋白质后,有两栏分别是sequence similarity和structure similarity,这个序列相似性和结构相似性是要说明什么?也没有别的蛋白和他比较啊,请问这块你知道么?谢谢
...

就是顾名思义了,从序列和结构两个角度比较similarity。它是跟其它蛋白比较的。

发自小木虫Android客户端
26楼2018-07-08 22:41:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 齐国小药童 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 3xN9SualEUPt 2026-10-24 4/200 2026-10-25 13:54 by XiYP04It3Evb
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 DI1qFHFK0KbE 2026-10-24 4/200 2026-10-25 13:28 by XiYP04It3Evb
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 4/200 2026-10-25 13:15 by XiYP04It3Evb
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 6/300 2026-10-25 13:11 by XiYP04It3Evb
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 9/450 2026-10-25 13:02 by XiYP04It3Evb
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 8/400 2026-10-25 12:59 by XiYP04It3Evb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 11/550 2026-10-25 12:49 by XiYP04It3Evb
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 10/500 2026-10-25 12:49 by XiYP04It3Evb
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 11/550 2026-10-25 12:45 by XiYP04It3Evb
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 4/200 2026-10-25 12:36 by XiYP04It3Evb
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 4/200 2026-10-25 12:32 by XiYP04It3Evb
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GVGRDgNfv7P4 2026-10-23 9/450 2026-10-25 12:10 by XiYP04It3Evb
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 GVGRDgNfv7P4 2026-10-23 4/200 2026-10-25 12:10 by XiYP04It3Evb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 4/200 2026-10-25 01:22 by XcOYG53d3x4p
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 8/400 2026-10-25 00:15 by XcOYG53d3x4p
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-23 8/400 2026-10-24 22:56 by XcOYG53d3x4p
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 7xHjyB3bAiwg 2026-10-24 3/150 2026-10-24 15:41 by Equinoxhua
[文学芳草园] 说走就走,走到哪便是哪 +5 Amei_123 2026-10-18 10/500 2026-10-23 22:38 by Amei_123
[文学芳草园] 亲密关系 +7 宋昙 2026-10-21 13/650 2026-10-23 17:07 by 小牧11
[考博] 27秋申博自荐 +4 且听风吟时 2026-10-21 4/200 2026-10-23 13:26 by 大大大肥虫
信息提示
请填处理意见