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szy572

新虫 (初入文坛)

[交流] 各种设计引物软件,都会出现多条引物供选择,为什么不需要扩增出CDS全长 已有5人参与

把CDS序列输入引物设计软件,会出现很多引物可供选择,主要是从CDS不同位置设计出的引物对。
我不明白为什么目的片段不是CDS全长,而只是一部分就可以了,哪位帮我解释下其中的具体原理
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luckydog52

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by szy572 at 2018-06-29 11:09:54
不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗?  为什么可以从中间位置引物起始复制,那岂不是部分的CDS,可以发挥作用吗,请指教具体原理,万分感谢...

你把软件想的太智能了,扩哪段序列需要你设定,你不设定当然软件就挑扩增效果最好的引物给你。至于扩增哪段序列,软件才不管呢

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自信源于一次次成功的积累
10楼2018-07-01 17:07:17
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hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
渊博震天: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-06-29 08:31:16
可能是你给的条件不够细致吧,对于扩全长的引物来说,你应该是需要手动设置调整的。

发自小木虫Android客户端
2楼2018-06-28 22:57:04
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luckydog52

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
渊博震天: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-06-29 08:31:28
上下游序列没有吗? 软件里面有个限制碱基位置的选项

发自小木虫Android客户端
自信源于一次次成功的积累
3楼2018-06-29 01:07:56
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渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-07-26 22:24:51
那个软件是需要加限定条件的,如果没有限定条件的话软件就默认选择为CDS中最适合的上下游引物,如果扩全长的话就直接在两头设计引物即可。
4楼2018-06-29 08:30:56
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