应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 各种设计引物软件，都会出现多条引物供选择，为什么不需要扩增出CDS全长
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
131/2返回列表12下一页
查看: 4607  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

szy572

新虫 (初入文坛)

[交流] 各种设计引物软件，都会出现多条引物供选择，为什么不需要扩增出CDS全长 已有5人参与

把CDS序列输入引物设计软件，会出现很多引物可供选择，主要是从CDS不同位置设计出的引物对。
我不明白为什么目的片段不是CDS全长，而只是一部分就可以了，哪位帮我解释下其中的具体原理
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2018-06-28 22:47:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
渊博震天: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-06-29 08:31:16
可能是你给的条件不够细致吧，对于扩全长的引物来说，你应该是需要手动设置调整的。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2018-06-28 22:57:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckydog52

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
渊博震天: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-06-29 08:31:28
上下游序列没有吗? 软件里面有个限制碱基位置的选项

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
自信源于一次次成功的积累
3楼2018-06-29 01:07:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-07-26 22:24:51
那个软件是需要加限定条件的，如果没有限定条件的话软件就默认选择为CDS中最适合的上下游引物，如果扩全长的话就直接在两头设计引物即可。
赞一下 回复此楼
4楼2018-06-29 08:30:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szy572

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-06-29 08:30:56
那个软件是需要加限定条件的，如果没有限定条件的话软件就默认选择为CDS中最适合的上下游引物，如果扩全长的话就直接在两头设计引物即可。

不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗？  为什么可以从中间位置引物起始复制，那岂不是部分的CDS，可以发挥作用吗，请指教，万分感谢
赞一下 回复此楼
5楼2018-06-29 10:49:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szy572

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by luckydog52 at 2018-06-29 01:07:56
上下游序列没有吗? 软件里面有个限制碱基位置的选项

不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗？  为什么可以从中间位置引物起始复制，那岂不是部分的CDS，可以发挥作用吗，请指教具体原理，万分感谢
赞一下 回复此楼
6楼2018-06-29 11:09:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
drwhoknowss: 金币+3, 鼓励交流 2018-07-02 01:28:43
引用回帖:
5楼: Originally posted by szy572 at 2018-06-29 10:49:36
不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗？  为什么可以从中间位置引物起始复制，那岂不是部分的CDS，可以发挥作用吗，请指教，万分感谢...

有时候是这样的，比如直接在两端设计引物P不出来，可以在中间设计引物，运用重叠PCR可以P出来
赞一下 回复此楼
7楼2018-06-29 11:13:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szy572

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-06-29 11:13:38
有时候是这样的，比如直接在两端设计引物P不出来，可以在中间设计引物，运用重叠PCR可以P出来...

那比如我们想过表达某个基因，是需要CDS全长吗，我真得不太明白具体原理
赞一下 回复此楼
8楼2018-06-29 22:09:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by szy572 at 2018-06-29 22:09:18
那比如我们想过表达某个基因，是需要CDS全长吗，我真得不太明白具体原理...

需要全长CDS基因

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
9楼2018-06-29 23:25:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckydog52

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by szy572 at 2018-06-29 11:09:54
不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗？  为什么可以从中间位置引物起始复制，那岂不是部分的CDS，可以发挥作用吗，请指教具体原理，万分感谢...

你把软件想的太智能了，扩哪段序列需要你设定，你不设定当然软件就挑扩增效果最好的引物给你。至于扩增哪段序列，软件才不管呢

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
自信源于一次次成功的积累
10楼2018-07-01 17:07:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 szy572 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 食品工程专硕求调剂 +3 小张zxy张 2026-03-26 3/150 2026-03-27 01:14 by dgnhs
[考研] 286求调剂 +3 lim0922 2026-03-26 3/150 2026-03-26 23:07 by 不吃魚的貓
[考研] 279求调剂 +6 红衣隐官 2026-03-21 6/300 2026-03-26 18:32 by 不吃魚的貓
[考研] 中国科学院深圳先进技术研究院-光纤传感课题组招生-中国科学院大学、深圳理工大学联培 +5 YangTyu1 2026-03-26 5/250 2026-03-26 18:27 by 猫咪猫咪呀
[材料工程] 一志愿C9材料与化工专业总分300求调剂 +5 曼111 2026-03-24 6/300 2026-03-26 13:04 by 13756423260
[考研] 296求调剂 +5 www_q 2026-03-20 5/250 2026-03-26 12:56 by 3Strings
[考研] 299求调剂 +4 15188958825 2026-03-25 4/200 2026-03-25 22:56 by 418490947
[考研] 321求调剂 +3 璞玉~~ 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:07 by Zhanglab-TJU
[考研] 26考研-291分-厦门大学（085601）-柔性电子学院材料工程专业求调剂 +3 min3 2026-03-24 4/200 2026-03-25 18:22 by xcjcqu
[考研] 296求调剂 +4 汪！？！ 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪！？！
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
[考研] 300分，材料，求调剂，英一数二 +5 超赞的 2026-03-24 5/250 2026-03-24 21:07 by 星空星月
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-24 5/250 2026-03-24 15:46 by 星空星月
[考博] 26申博自荐 +3 whh869393 2026-03-24 3/150 2026-03-24 09:55 by 21018060
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 298求调剂 +8 上岸6666@ 2026-03-20 8/400 2026-03-23 11:02 by laoshidan
[考研] 材料与化工085600，总分304，本科有两篇sci参与，求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭