24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 4609  |  回复: 12

szy572

新虫 (初入文坛)

[交流] 各种设计引物软件,都会出现多条引物供选择,为什么不需要扩增出CDS全长 已有5人参与

把CDS序列输入引物设计软件,会出现很多引物可供选择,主要是从CDS不同位置设计出的引物对。
我不明白为什么目的片段不是CDS全长,而只是一部分就可以了,哪位帮我解释下其中的具体原理
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
渊博震天: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-06-29 08:31:16
可能是你给的条件不够细致吧,对于扩全长的引物来说,你应该是需要手动设置调整的。

发自小木虫Android客户端
2楼2018-06-28 22:57:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckydog52

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
渊博震天: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-06-29 08:31:28
上下游序列没有吗? 软件里面有个限制碱基位置的选项

发自小木虫Android客户端
自信源于一次次成功的积累
3楼2018-06-29 01:07:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-07-26 22:24:51
那个软件是需要加限定条件的,如果没有限定条件的话软件就默认选择为CDS中最适合的上下游引物,如果扩全长的话就直接在两头设计引物即可。
4楼2018-06-29 08:30:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szy572

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-06-29 08:30:56
那个软件是需要加限定条件的,如果没有限定条件的话软件就默认选择为CDS中最适合的上下游引物,如果扩全长的话就直接在两头设计引物即可。

不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗?  为什么可以从中间位置引物起始复制,那岂不是部分的CDS,可以发挥作用吗,请指教,万分感谢
5楼2018-06-29 10:49:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szy572

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by luckydog52 at 2018-06-29 01:07:56
上下游序列没有吗? 软件里面有个限制碱基位置的选项

不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗?  为什么可以从中间位置引物起始复制,那岂不是部分的CDS,可以发挥作用吗,请指教具体原理,万分感谢
6楼2018-06-29 11:09:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
drwhoknowss: 金币+3, 鼓励交流 2018-07-02 01:28:43
引用回帖:
5楼: Originally posted by szy572 at 2018-06-29 10:49:36
不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗?  为什么可以从中间位置引物起始复制,那岂不是部分的CDS,可以发挥作用吗,请指教,万分感谢...

有时候是这样的,比如直接在两端设计引物P不出来,可以在中间设计引物,运用重叠PCR可以P出来
7楼2018-06-29 11:13:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szy572

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-06-29 11:13:38
有时候是这样的,比如直接在两端设计引物P不出来,可以在中间设计引物,运用重叠PCR可以P出来...

那比如我们想过表达某个基因,是需要CDS全长吗,我真得不太明白具体原理
8楼2018-06-29 22:09:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by szy572 at 2018-06-29 22:09:18
那比如我们想过表达某个基因,是需要CDS全长吗,我真得不太明白具体原理...

需要全长CDS基因

发自小木虫Android客户端
9楼2018-06-29 23:25:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luckydog52

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by szy572 at 2018-06-29 11:09:54
不是所有所需目的片段都应该是CDS全长吗?  为什么可以从中间位置引物起始复制,那岂不是部分的CDS,可以发挥作用吗,请指教具体原理,万分感谢...

你把软件想的太智能了,扩哪段序列需要你设定,你不设定当然软件就挑扩增效果最好的引物给你。至于扩增哪段序列,软件才不管呢

发自小木虫Android客户端
自信源于一次次成功的积累
10楼2018-07-01 17:07:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 szy572 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +6 kongweilin 2026-03-26 8/400 2026-03-27 10:18 by FF_16
[考研] 308求调剂 +6 墨墨漠 2026-03-25 6/300 2026-03-27 09:34 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +4 @taotao 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:10 by hypershenger
[考研] 一志愿太原理工安全工程300分,求调剂 +3 0857求调剂. 2026-03-24 3/150 2026-03-27 01:18 by 求知若渴lz
[考研] 352求调剂 +4 大米饭! 2026-03-22 4/200 2026-03-26 16:40 by 不吃魚的貓
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 085601求调剂总分293英一数二 +4 钢铁大炮 2026-03-24 4/200 2026-03-26 16:28 by dick_runner
[考研] 材料277求调剂 +5 min3 2026-03-24 5/250 2026-03-26 15:13 by zzll406
[考研] 环境专硕324分求调剂推荐 +5 轩小宁—— 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:05 by i_cooler
[考研] 一志愿哈工大,085400,320,求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 26考研-291分-厦门大学(085601)-柔性电子学院材料工程专业求调剂 +3 min3 2026-03-24 4/200 2026-03-25 18:22 by xcjcqu
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 上海电力大学材料防护与新材料重点实验室招收调剂研究生(材料、化学、电化学,环境) +4 我爱学电池 2026-03-23 4/200 2026-03-25 00:59 by 1027_324
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-24 3/150 2026-03-24 21:31 by peike
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +5 WW.' 2026-03-23 7/350 2026-03-24 14:50 by sprinining
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
信息提示
请填处理意见