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daid01

金虫 (小有名气)

[求助] 引物设计添加信号肽,求助大神们!!!

各位大神,我的老板最近想要在我们设计的引物上添加信号肽,使目的蛋白表达为信号肽(我们蛋白原本为包涵体蛋白)。
我查了一些资料,现在有几个问题,望大神们能帮帮忙~~
1.有的资料说含有信号肽引物设计时,应当是“保护碱基+ATG+信号肽+ATG+目的序列”,应当是这样吗?两个起始子是否会影响我的目的蛋白的表达?或者可以添加在下游终止子前面?
2.对于信号肽序列,是根据什么要求在引物中添加呢?是否是信号肽序列就可以?部分资料中的信号肽序列都好长啊~,如果按照这个要求设计引物,势必会对上下游引物的退火温度等相关数据产生影响,而且会影响PCR的结果,是否有相关方法可以避免呢?
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memorize1991

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2018-05-08 07:56:39
不太明白你的意思,做分泌蛋白表达的话是根据你的表达系统的。我们实验室做真核表达体系,一般用哺乳动物的信号肽,如果你用原核生物表达当然就用原核生物的信号肽了。如果你蛋白本身为包涵体蛋白你分泌表达不会影响它正常的结构吗?添加信号肽你用重叠PCR就行,先重叠P出信号肽,然后用酶切酶连的方式放到起始密码子前,真核生物的话,在信号肽后会放一段Kozak序列用来增强表达。至于你说的保护碱基一般用6到8个,反正便宜,我们一般都用8个,这只是用来方便酶切后把信号肽连上载体上的,平末端的话,你只需要一半就行,不用加保护碱基。真核生物信号肽就100多核苷酸吧,不是很多吧分成几段重叠延伸很容易就出来了。

发自小木虫Android客户端
3楼2018-05-08 00:20:30
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Congcongaha

银虫 (小有名气)

2楼2018-05-07 12:46:48
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daid01

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by memorize1991 at 2018-05-08 00:20:30
不太明白你的意思,做分泌蛋白表达的话是根据你的表达系统的。我们实验室做真核表达体系,一般用哺乳动物的信号肽,如果你用原核生物表达当然就用原核生物的信号肽了。如果你蛋白本身为包涵体蛋白你分泌表达不会影响 ...

哦哦 好的 非常感谢~
4楼2018-05-09 11:21:23
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