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魔鬼的天使

金虫 (小有名气)

[求助] 求助SNP位点rs34743033普通PCR引物设计,用于一代测序已有1人参与

跪求各位大神,帮忙设计一下SNP位点rs34743033的引物,本人已经设计好几次了,效果都不好,求助大神施以援手
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自控,自信
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wxm0212

新虫 (正式写手)

一代测序引物应该好设计,你遇到神马情况

发自小木虫Android客户端
2楼2018-04-02 12:02:40
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匿名

本帖仅楼主可见
3楼2018-04-02 22:22:29
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tayifeita

木虫 (小有名气)

你是遇到什么问题了呀,一般一代测序引物能把目的片段扩出来,无特异性片段就ok了呀

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2018-04-03 09:20:20
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tayifeita

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你这个SNP是一段序列,刚好是个STR区域,CCGCGCCACTTCGCCTGCCTCCGTCCCG重复2/3/4 ,给你在NCBI上面找了一对引物,应该没问题、


Forward primer        ATACCACTTGCTTCGGTTGCT       
Reverse primer        CCTGCATGCCGAATACCGA       
Product length        673

建议反向测序,下游引物离插入点比较近
5楼2018-04-03 09:50:39
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