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wahaha8127

银虫 (小有名气)

[交流] 细菌RNA提取要注意什么啊?

请问大家有没有提取细菌RNA的经验啊 怎么老是降解呢? 操作中应该注意什么 我使用的方法提取组织的RNA都是可以的 但是细菌的降解很厉害 请高手指教

[ Last edited by 350784478 on 2009-10-10 at 13:33 ]
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doctorzhjw

木虫 (文坛精英)

小木虫灌水博士


wahaha8127(金币+1,VIP+0):谢谢! 3-16 10:39
细菌的总RNA主要由rRNA、tRNA及mRNA组成,其中rRNA含量最多(占80%~85%),RNA的分离提取中最关键的因素是尽量减少纯化过程中内源核外源性RNA酶对RNA的降解。所以实验过程中要有效去除RNA提取中的DNA和蛋白质。采用高活性RNA酶抑制剂可以防止RNA降解,采用酚、氯仿抽提可以方便地去除RNA提取物中的蛋白质。实验中所用到的TRIzol是一种酚和RNA酶抑制剂的混合物,它能在破碎和溶解细胞时保持RNA的完整性。实验试剂及用品用0.1%DEPC水处理,实验过程中也需注意尽量避免RNA酶污染。

RNA的提取:
             1.2ml过夜培养的细菌LB培养液

            10000r/min,离心1min,收集菌体

向EP管中加入1mlTRIzol试剂,用枪头反复吹打裂解细胞,室温放置5min

            向EP管中加入0.2ml氯仿,用力摇晃30秒钟,冰浴10 min

                      10000r/min,4oC离心15min

               小心吸取上层无色水样层转移至一新EP管中

     加入0.5ml异丙醇,室温放置10min或-20o放置几个小时

           10000r/min,4oC离心10min,轻轻倒去上清

加入1ml 75%乙醇洗涤RNA沉淀一次,用枪头吹打均匀,8000r/min,4oC离心5min

              弃上清,空气干燥,加入20ul无RNA酶的DEPC水

          取溶解后RNA样品进行1%琼脂糖凝胶电泳鉴定
人外有人山外有山天外有天
2楼2009-03-16 09:41:04
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wahaha8127

银虫 (小有名气)

谢谢楼上的回答!细菌培养要用LB培养基吗?我们常用的是NB培养基 培养基的不同应该不会影响提取RNA的质量吧? 另:细菌不用液氮研磨吗?同学说液氮研磨可以消除一部分表面的RNA酶
3楼2009-03-16 10:41:50
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