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婷宝宝2013

银虫 (小有名气)

[求助] 找不到序列的基因怎么设计引物p啊 已有2人参与

rt，请教下有相关经验的小虫，要P目的菌株中的一个基因，通过测物质的转化确定应该是存在这个基因的。但是这个基因序列在NCBI上是找不到，那我应该怎么设计引物P基因啊，肿么办，求支招？？？大神们，帮帮忙···
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1楼 2017-11-07 16:41:04
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cxh90

新虫 (著名写手)
可以没有命名，你用的模式生物的基因序列比对看看

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5楼2018-10-05 19:55:57
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璐璐sunny

铁杆木虫 (正式写手)
目的菌株的全基因组序列有人上传么？有的话下载下来按基因名查找应该是可以找到的。另外你在NCBI上怎么搜的目的基因？有的某一个基因对应的蛋白叫法不一样，可以都试一下

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2楼2017-11-07 17:35:22
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婷宝宝2013

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 璐璐sunny at 2017-11-07 17:35:22
目的菌株的全基因组序列有人上传么？有的话下载下来按基因名查找应该是可以找到的。另外你在NCBI上怎么搜的目的基因？有的某一个基因对应的蛋白叫法不一样，可以都试一下
...

全基因组序列是有的，下载下来全是一连串碱基序列怎么查啊？我在NCBI上就是输了这个基因的全称和缩写都试了，没有查到。
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3楼2017-11-07 20:27:26
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璐璐sunny

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 婷宝宝2013 at 2017-11-07 20:27:26
全基因组序列是有的，下载下来全是一连串碱基序列怎么查啊？我在NCBI上就是输了这个基因的全称和缩写都试了，没有查到。...

下载全基因组的时候右上角可以选择coding sequence，下载下来就是每个基因连起来的序列，你试一下

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4楼2017-11-07 22:22:24
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