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土豆芽之力

铁虫 (初入文坛)

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专业: 生物信息学

[求助] 关于perl中计算字符数的问题

这段代码用来计算一段氨基酸序列的长度：
print "Type the filename of protein sequencedata that you want to search:\n";
$filename = <STDIN>;

unless ( open(FILE, $filename))
{
print "Cannot find the file.\n";
exit;
}

@protein = <FILE>;
close FILE;

$protein = join( '', @protein);
$protein =~ s/\s//g;

$count = ($protein =~ s/([a-z])/1/isg);

print "The length of sequence is :", $count;

这一段测试有效且正确。
其中
$count = ($protein =~ s/([a-z])/1/isg);
这条代码是在查阅资料后写的。
但不明白其中的原理。

经测试，
当将代码$count = ($protein =~ s/([a-z])/1/isg)替换成$count = $protein或$count = ($protein)时，得到的结果都是一整段蛋白质序列而不是一个整数。理解是，这样直接将变量$protein的内容赋值到$count中了，没有计算。
当替换成$count = ('1','2','3','4','1')时，得到的结果是5。可见这里产生了计算。
但是，当$count = ($protein)时，不是可以近似看成$count = ('m','s','a','s',...);吗？为什么这样又不会产生计算了呢？
而经过（$protein =~ s/([a-z])/1/isg）这条代码将字符替换一遍后，却能计算字符数了！

发自小木虫IOS客户端

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1楼 2017-10-14 23:51:23

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