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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 基因分析精细图
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一抹念想

新虫 (正式写手)

[交流] 基因分析精细图

有一株真菌的全基因序列，现需对其进行分析，希望能绘制出精细图，但本人第一次接触这方面，不是太了解，希望大牛指导指导

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1楼 2017-10-05 07:24:43
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suyouzhen

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
33楼: Originally posted by 一抹念想 at 2017-10-07 21:29:17
用于发文章，展示基因组特征的图圈
...

试试用Circos做此类圈图，是发基因组文章时绘图常用软件。缺点是写配置文件比较麻烦，你看看教程，应该能找到相应的模板自己修改一下。
http://circos.ca/documentation/tutorials/
赞一下 回复此楼
34楼2017-10-07 22:05:59
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598878157

版主 (文学泰斗)
★
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
祝好

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5楼2017-10-05 08:47:46
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suyouzhen

铁杆木虫 (小有名气)
★
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
我们在谈论基因组精细图的时候，往往指经过测序拼装后满足某些技术指标的拼装序列，如相对整个基因组的覆盖度，contigs/scaffold的平均长度，错误率等等。你指的是这个精细图么？还是说你想画一个用于发表文章用的，用来展示基因组特征的图表？比如圈图？
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9楼2017-10-05 17:39:01
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一抹念想2楼
2017-10-05 07:26   回复  
zhaoyan19784楼
2017-10-05 08:38   回复  
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
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dongmings6楼
2017-10-05 09:01   回复  
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
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朝都7楼
2017-10-05 10:11   回复  
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
好 发自小木虫Android客户端
nono200911楼
2017-10-05 18:19   回复  
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
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