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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 基因分析精细图
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一抹念想

新虫 (正式写手)

[交流] 基因分析精细图

有一株真菌的全基因序列，现需对其进行分析，希望能绘制出精细图，但本人第一次接触这方面，不是太了解，希望大牛指导指导

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1楼 2017-10-05 07:24:43
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598878157

版主 (文学泰斗)
★
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
祝好

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5楼2017-10-05 08:47:46
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suyouzhen

铁杆木虫 (小有名气)
★
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
我们在谈论基因组精细图的时候，往往指经过测序拼装后满足某些技术指标的拼装序列，如相对整个基因组的覆盖度，contigs/scaffold的平均长度，错误率等等。你指的是这个精细图么？还是说你想画一个用于发表文章用的，用来展示基因组特征的图表？比如圈图？
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9楼2017-10-05 17:39:01
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tableman

木虫之王 (文学泰斗)
★
一抹念想(金币+1): 谢谢参与
花开富贵   
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16楼2017-10-05 22:40:16
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一抹念想

新虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by suyouzhen at 2017-10-05 17:39:01
我们在谈论基因组精细图的时候，往往指经过测序拼装后满足某些技术指标的拼装序列，如相对整个基因组的覆盖度，contigs/scaffold的平均长度，错误率等等。你指的是这个精细图么？还是说你想画一个用于发表文章用的， ...

用于发文章，展示基因组特征的图圈

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33楼2017-10-07 21:29:17
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suyouzhen

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
33楼: Originally posted by 一抹念想 at 2017-10-07 21:29:17
用于发文章，展示基因组特征的图圈
...

试试用Circos做此类圈图，是发基因组文章时绘图常用软件。缺点是写配置文件比较麻烦，你看看教程，应该能找到相应的模板自己修改一下。
http://circos.ca/documentation/tutorials/
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34楼2017-10-07 22:05:59
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青青大橙子

新虫 (小有名气)
我们公司可以帮您做这个的

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36楼2017-10-11 13:32:48
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呆呆戴戴

新虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主 你的问题解决了吗

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37楼2018-06-30 13:27:36
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一抹念想

新虫 (正式写手)
引用回帖:
37楼: Originally posted by 呆呆戴戴 at 2018-06-30 13:27:36
楼主 你的问题解决了吗

没有

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38楼2018-06-30 17:06:52
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一抹念想2楼
2017-10-05 07:26   回复  
tzynew3楼
2017-10-05 08:04   回复  
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zhaoyan19784楼
2017-10-05 08:38   回复  
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dongmings6楼
2017-10-05 09:01   回复  
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朝都7楼
2017-10-05 10:11   回复  
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syhorchid8楼
2017-10-05 10:50   回复  
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youngen10楼
2017-10-05 18:13   回复  
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nono200911楼
2017-10-05 18:19   回复  
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。 发自小木虫Android客户端
假大空12楼
2017-10-05 18:42   回复  
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顶
fvudh97413楼
2017-10-05 22:33   回复  
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技靶hpu14楼
2017-10-05 22:37   回复  
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dfqnyqe45015楼
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zyskgef5617楼
2017-10-05 22:41   回复  
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bkkkmze8918楼
2017-10-05 22:45   回复  
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塞北先生19楼
2017-10-05 22:49   回复  
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egnee1120楼
2017-10-06 09:00   回复  
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sktzhdv36121楼
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稍屹6222楼
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ruscms66023楼
2017-10-06 10:15   回复  
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ygvkbp8324楼
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shuwenhe25楼
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1
csbbrvs6026楼
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xiaoqiuqiu2027楼
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htufuje7128楼
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kchjmgr1629楼
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uajwyy92130楼
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庞幌yvh31楼
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v7555818032楼
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一抹念想35楼
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