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sevenwish

新虫 (小有名气)

[求助] 鼠尾基因型鉴定,总P不出目的条带。

我们定了一批KO小鼠,做基因型鉴定。总使用含有SDS的lysis buffer 以及家蛋白酶K 裂解鼠尾,然后用乙醇沉淀基因组DNA。基因组我跑了电泳,有蛋白残留,在孔里,但是基因组DNA确实有条带。     后面进行PCR,有一个目的条带3.9k.始终p.不出来,其他两个条带1K和0.5k都可以。   改变了条件,使用高保真都没出现过。  而且奇怪的是的,在WT本不该有1K,但是,有了。   现在人没在实验室,我过一会发个图。  求大神解释原因可能在哪?

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不吃M的鱼

金虫 (小有名气)

3.9k是不是有点长了不好扩增?我做鱼的,长的有时候不太好扩

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2楼2017-09-09 08:38:53
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sevenwish

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 不吃M的鱼 at 2017-09-09 08:38:53
3.9k是不是有点长了不好扩增?我做鱼的,长的有时候不太好扩

确实不好p,但是,公司那边做出来没问题,我们就是重复不出来。给另一个老师做的鉴定,他们的很短,很好p,所以应该排除操作原因。条件也换过很多。延伸到5分钟都没有,高保真也没有。

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3楼2017-09-09 08:45:14
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不吃M的鱼

金虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-09-09 19:26:47
长的确实不好P,可能酶不一样,也有可能模板提的质量不怎么好,原因很多。建议你设计一对短的引物试试。你们敲除的前段应该不长吧,为什么要用这么长的引物坚定呢?

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4楼2017-09-09 08:47:48
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bsese

至尊木虫 (文坛精英)

山顶拟诗 歌得吧贺
5楼2017-09-09 08:50:41
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橙子哥01

新虫 (小有名气)

为什么要设计那么长的引物

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6楼2017-09-09 08:54:33
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tinyruby

至尊木虫 (知名作家)

7楼2017-09-09 09:01:44
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2386646287

新虫 (初入文坛)

我也遇到同样的情况,Wt不该有的条带的反而有了

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8楼2017-09-12 20:50:21
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sevenwish

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 2386646287 at 2017-09-12 20:50:21
我也遇到同样的情况,Wt不该有的条带的反而有了

最后找到原因了么?还是因为单纯的非特异?

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9楼2017-09-14 10:17:59
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