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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 在NCBI上提交序列有误，附提交内容，自己不清楚哪里有误，求解决方式！
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xiaoyu654458

新虫 (小有名气)

[求助] 在NCBI上提交序列有误，附提交内容，自己不清楚哪里有误，求解决方式！ 已有1人参与

LOCUS       BSeq#1                   599 bp    mRNA    linear       16-AUG-2017
DEFINITION  Catathelasma ventricosum CV-1 chloroplast.
ACCESSION   BSeq#1
VERSION
KEYWORDS    .
SOURCE      chloroplast Catathelasma ventricosum CV-1
  ORGANISM  Catathelasma ventricosum CV-1
            Unclassified.
REFERENCE   1  (bases 1 to 599)
  AUTHORS   Liu,Y.T.
  TITLE     Unpublished
  JOURNAL   Unpublished
REFERENCE   2  (bases 1 to 599)
  AUTHORS   Liu,Y.T.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (16-AUG-2017) Sichuan Agricultural University, school of
            food, The new road No. 46, yaan, sichuan 625014, china
COMMENT     Bankit Comment: ALT EMAIL:nutritionlab@sicau.edu.cn.
            Bankit Comment: TOTAL # OF SEQS:1.
            Bankit Comment: TAX: No, not new species/combinations.
            
            ##Assembly-Data-START##
            Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing
            ##Assembly-Data-END##
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..599
                     /organism="Catathelasma ventricosum CV-1"
                     /organelle="plastid:chloroplast"
                     /mol_type="mRNA"
                     /culture_collection="mycelium"
     misc_RNA        <1..>194
                     /product="internal transcribed spacer 1"
     rRNA            195..352
                     /product="5.8S ribosomal RNA"
     misc_RNA        <353..>599
                     /product="internal transcribed spacer 2"
BASE COUNT      150 a    127 c    126 g    196 t
ORIGIN      
        1 gcactctgtg tagacctagg ctgatacctc tcgaggtgac tcggttagag gactgactaa
       61 ctggtgtgtg gcaggatgac tgtccttgca ttccgtggtc tatgttatct tctcctggtt
      121 tcttacaagg agatcatcaa ttatttaatg taattatatc agcccacgca tttatcatga
      181 tttttgtagg cctccctgta ggtctatgtt ttcttataca acccacaata aacatgtcat
      241 tgagtgcgat ttaatcgtgg acttgtgtcc tttaaatgtt aatacaactt tcaacaacgg
      301 atctcttggc tctcgcatcg atgaagaacg cagcgaaatg cgataagtaa tgtgaattgc
      361 agaattcagt gaatcatcga atctttgaac gcaccttgcg ctccttggta ttccgaggag
      421 catacctgtt tgagtgtcat taaattctca acctttccag cttcttggtc aggcttggat
      481 aatgggggat gtaggcttct cagaagtctg ctcctctcaa aagtattagc agaaccttgt
      541 gcagatttgg tgtgataatt atctactcca agcagccatt ttcagttcag ctttcaaca
//
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1楼 2017-08-17 09:13:55
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoyu654458: 金币+20, ★★★很有帮助 2017-08-18 20:10:30
你的序列不是mRNA，是rRNA，序列类型填错了。
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2楼2017-08-17 14:11:09
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xiaoyu654458

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2017-08-17 14:11:09
你的序列不是mRNA，是rRNA，序列类型填错了。

序列类型是怎么确定呢？我是第一次接触基因序列这一方面，所以有些不了解
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3楼2017-08-17 20:29:51
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

现在NCBI提交rRNA-ITS序列专门有个网页https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/genbank/
如果还是bankit页面提交的话，在features那一项中选择“非编码RNA”项。
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4楼2017-08-17 23:14:23
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xiaoyu654458

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2017-08-17 23:14:23
现在NCBI提交rRNA-ITS序列专门有个网页https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/genbank/
如果还是bankit页面提交的话，在features那一项中选择“非编码RNA”项。

只有这一个问题么？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2017-08-18 07:42:43
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西西sm

新虫 (正式写手)
那这个修改怎么弄呀

发自小木虫IOS客户端
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6楼2017-09-28 08:12:16
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