应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 关于用MeV做热图
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 10797  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

1937mcq

主管区长

努力后生

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[求助] 关于用MeV做热图 已有4人参与

我想用MeV软件做热力图，但是以别人的帖子中地址下载了软件后，解压发现跟别人解压后的不一样，需要的TMEV,bat刚好就没有，其他的都和别人的一样。这就让我很尴尬，不知道还有没有别的方法。下面就是我的和别人的区别，没有最后一个文件

关于用MeV做热图
BEZ%58}~{A_S`@}NC)V5}U5.png


关于用MeV做热图-1
SS(S_(RBBP6H{$Y6Q1X11IW.png
回复此楼

» 猜你喜欢
心若向阳，无谓悲伤！
1楼 2017-08-03 12:40:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

YY荣耀出品

管理员

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 1937mcq at 2017-08-03 13:32:45
可是，MeV程序运行前要让我下一个JAVA软件，下载了，安装了又不能用，反正就很烦

安装在桌面试试，这个与你用的电脑系统有关系。
赞一下 回复此楼
6楼2017-10-11 15:21:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

晋鹏

禁虫

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
聚类热图是我们展示芯片、或者测序结果比较常用的方式，在文章中出现的频率非常高，一般来说，这张图的每行对应一个基因，每列对应一个样本，行和列形成的是基因数*样本数的表格，接下来用不同的颜色代表基因在样本中的表达量。

我们用MeV的最新版本4.9.0来演示，用到的数据是本人在用R语言绘制的时候用到的数据，


软件下载后直接打开Mev.exe软件：

关于用MeV做热图-2

接下来我们导入数据，用的文件是百度盘里面的heatmap_example.txt，我们选择file-load data后跳出下面的页面：

关于用MeV做热图-3

我们看到数据已经导入了，数据时miRNA的表达谱数据，一共有2组，每组4个样本，共8个样本，我们单击load后就生成了下面的图片：

关于用MeV做热图-4

这样热图就做好了，解析来我们进行聚类，选择左上角的Clustering，我们看到这里的聚类方法包括分层聚类（Hierarchical Clustering），Tree EASE，自组织映射,k-means聚类等等。

关于用MeV做热图-5

这里我们既进行基因，又进行样本的聚类，距离计算按照欧式距离来计算，选好后单击OK：

如图，在Display里面，选择Set Element Size后右侧选择图片大小，也可以选择Custom我们自己来设置大小：

关于用MeV做热图-6

主要是样本之间聚类的不同，我们换种计算距离的方式，用Pearson相关系数聚类，就把对照组和实验组区分开了。
赞一下 回复此楼
及时行乐，人生不留遗憾！
2楼2017-08-03 13:10:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1937mcq

版主

努力后生

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
可是，MeV程序运行前要让我下一个JAVA软件，下载了，安装了又不能用，反正就很烦
赞一下 回复此楼
心若向阳，无谓悲伤！
3楼2017-08-03 13:32:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1937mcq

专家顾问

努力后生

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-08-03 13:10:54
聚类热图是我们展示芯片、或者测序结果比较常用的方式，在文章中出现的频率非常高，一般来说，这张图的每行对应一个基因，每列对应一个样本，行和列形成的是基因数*样本数的表格，接下来用不同的颜色代表基因在样本 ...

谢谢，我已经会做了，但是我出现了新的问题，就是我总共有一百个基因，但是一起的做的话就会出现如下图一所示的样子，好像只有基因小于一定的数目（大约20）时才可以做成图二的样子，请问这要怎么解决呢？？？？要是一百个不能一起，我也可以分成三组这样子。希望知道的话为我解答，万分感谢！！！
关于用MeV做热图-7
BD9[LO3LPP2DHAWT$Q@M6[A.png


关于用MeV做热图-8
2~37{KC6WDS{FJ}U)36K3J6.png
赞一下 回复此楼
心若向阳，无谓悲伤！
4楼2017-08-03 15:18:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 352分-085602-一志愿985 +6 海纳百川Ly 2026-03-29 6/300 2026-03-31 21:06 by yuq
[考研] 311求调剂一志愿合肥工业大学 +11 秋二十二 2026-03-30 11/550 2026-03-31 18:09 by 253863592
[考研] 生医工0831调剂求推荐 +4 小熊睿睿_s 2026-03-27 6/300 2026-03-31 17:12 by 记事本2026
[考研] 生物学296求调剂 +8 汤圆包 2026-03-29 12/600 2026-03-31 17:05 by 18828373951
[考研] 330分求调剂 +6 qzenlc 2026-03-29 6/300 2026-03-31 16:44 by Wang200018
[考研] 08工科，295，接受跨专业调剂 +4 lmnlzy 2026-03-31 4/200 2026-03-31 15:25 by 西京学院招办
[考研] 一志愿中海洋材料357 +4 麦恩莉. 2026-03-30 4/200 2026-03-31 14:35 by 记事本2026
[考研] 085600 295分求调剂 +13 W55j 2026-03-30 15/750 2026-03-31 13:29 by 王亮_大连医科大
[考研] 293求调剂 +3 末未mm 2026-03-30 5/250 2026-03-30 17:23 by 王保杰33
[考研] 321求调剂 +7 璞玉~~ 2026-03-25 8/400 2026-03-29 06:41 by 544594351
[考研] 316求调剂 +7 江辞666 2026-03-26 7/350 2026-03-28 21:28 by sanrepian
[考研] 283求调剂 +3 A child 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:41 by ms629
[考研] 312，生物学求调剂 +3 小译同学abc 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:32 by 落睿可思
[考研] 求调剂 +4 零八# 2026-03-27 4/200 2026-03-27 18:07 by yu221
[考研] 复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[考研] 305求调剂 +5 哇卢卡库 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:01 by laoshidan
[考研] 考研调剂 +9 小蜡新笔 2026-03-26 9/450 2026-03-27 11:10 by 不吃魚的貓
[考研] 材料求调剂 +5 .m.. 2026-03-25 5/250 2026-03-27 11:08 by 不吃魚的貓
[考研] 324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-26 5/250 2026-03-27 10:33 by wangjy2002
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭