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求助!用高保真酶PCR,无条带却胶孔亮是怎么回事?急! 已有3人参与
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用的拟南芥cDNA做的PCR,目标条带2400bp,之前是用Taq酶可以p出来,做的退火温度梯度,发现56度最合适(图1第二泳道),之后就用高保真pfu做,50ul体系:模板1ul,上下引物各1ul,pfu酶 1ul,buffer 10ul,dNTP 4ul,ddH2O 32ul. 程序按全式金pfu说明书来的:95°5:00,95°20s,56°20s,72°1:30,37个循环,72°5:00。琼脂糖胶配的是1.2%,也换了新电泳液,然而还是跑不出来(图二)maker都是5000bp……重复好多次都是这样。请问有没有可能是模板浓度太高了?需要稀释多少倍?还是引物有问题?挺急的,谢谢各位大神啦! 发自小木虫Android客户端 |
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今天的实验模板已经稀释了5倍,现在浓度是47ng/ul,可以看到胶孔已经没有昨天亮了,但是泳道依旧很亮,可以看到有浅浅的目标条带(第四泳道),做了个退火梯度,依次是56,54,54,53,我的体系是25ul的,分别是模板0.5ul,上下引物各0.5ul,buffer 2.5ul,dNTP 2ul,Taq酶 0.5ul,ddH2O 18.5ul, 程序是95°4min,95°30s,53~56°30s,72°2min40s,35个循环,72°10min,用得是泽星的taq酶,胶浓度1.0%,是否是引物特异性不好,需要重新设引物吗? 发自小木虫Android客户端 |
7楼2017-07-20 21:31:18
zhouxfd
木虫 (正式写手)
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2楼2017-07-20 08:33:17
bbqlhb
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3楼2017-07-20 08:40:18
4楼2017-07-20 10:22:30














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