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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】请帮我讲解一下些输出文件
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wwj_0905

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请帮我讲解一下些输出文件

# Electronic parameters                                                         <--
Spin_polarization             unrestricted                                      <--
Charge                        0                                                 <--
Basis                         dn                                                <--
Pseudopotential               none                                              <--
Functional                    pbe                                               <--
Aux_density                   octupole                                          <--
Integration_grid              coarse                                            <--
Occupation                    fermi                                             <--
Cutoff_Global                 3.0000 angstrom                                   <--
Scf_density_convergence       1.0000e-004                                       <--
Scf_charge_mixing             0.0170                                            <--
Scf_spin_mixing               0.5000                                            <--
Scf_iterations                50                                                <--
Scf_diis                      6 pulay   


Hydrogen     nbas=  1, z=   1, nrfn=  3, rcut=  5.67, e_ref= -0.047605 Ha
   n=1  L=0  occ= 1.00 e=      -0.215484Ha        -5.8636eV
   n=1  L=0  occ= 0.00 e=      -0.844172Ha       -22.9711eV
   n=2  L=1  occ= 0.00 e=      -1.999810Ha       -54.4176eV  eliminated
Carbon       nbas=  2, z=   6, nrfn=  7, rcut=  5.67, e_ref= -0.066236 Ha
   n=1  L=0  occ= 2.00 e=      -9.982571Ha      -271.6397eV
   n=2  L=0  occ= 2.00 e=      -0.467375Ha       -12.7179eV
   n=2  L=1  occ= 2.00 e=      -0.150150Ha        -4.0858eV
   n=2  L=0  occ= 0.00 e=      -1.482166Ha       -40.3318eV
   n=2  L=1  occ= 0.00 e=      -1.165960Ha       -31.7274eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -2.721908Ha       -74.0669eV  eliminated
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -1.380329Ha       -37.5607eV  eliminated
Fluorine     nbas=  3, z=   9, nrfn=  7, rcut=  5.67, e_ref= -0.019132 Ha
   n=1  L=0  occ= 2.00 e=     -24.337464Ha      -662.2564eV
   n=2  L=0  occ= 2.00 e=      -1.085745Ha       -29.5446eV
   n=2  L=1  occ= 5.00 e=      -0.398014Ha       -10.8305eV
   n=2  L=0  occ= 0.00 e=      -2.494863Ha       -67.8887eV
   n=2  L=1  occ= 0.00 e=      -1.800889Ha       -49.0047eV
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -2.721908Ha       -74.0669eV  eliminated
   n=3  L=2  occ= 0.00 e=      -1.380329Ha       -37.5607eV  eliminated

Symmetry orbitals
    n  norb    representation
    1    37        a   
total number of valence orbitals:     37


Message: Start SCF iterations

        Total E (au)     Binding E (au)     Convergence     Time (m)   Iter
-----------------------------------------------------------------------------
Ef      -178.6781040       -0.9507402         0.15E+00        0.023      1
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。

Energy of Highest Occupied Molecular Orbital  -0.27315Ha    -7.433eV
  HOMO is orbital number    26
  LUMO is orbital number    27

    state                         eigenvalue        occupation
                              (au)          (ev)

    1   -   1   a        -24.226977      -659.250     1.000
    2   +   1   a        -24.226972      -659.250     1.000
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。

Orbital occupation is:
   13  a  ( 1) alpha and  13  a  ( 1) beta
  Total number electrons:              26.0


df              ATOMIC  COORDINATES (au)                  DERIVATIVES (au)
df            x          y          z            x          y          z
-----------------------------------------------------------------------------
df    H     1.597643   1.720242   1.771919    -0.001540  -0.013177   0.020712
df    C     1.889726   2.910178   0.000000     0.023214   0.003671   0.006359
df    C     4.632191   3.820213  -0.108640     0.023672  -0.023919   0.060079
df    H     1.458393   1.720243  -1.743261     0.000908  -0.012058  -0.021165
df    H     0.569931   4.612048   0.052283    -0.009909   0.022183  -0.000441
df    H     5.607952   2.956563  -1.824144     0.003654  -0.010807  -0.018822
df    F     5.837439   3.075850   2.056457    -0.034942   0.012767  -0.045947
df    H     4.675490   5.968886  -0.257923    -0.005057   0.021341  -0.000775
-----------------------------------------------------------------------------

        Total E (au)     Binding E (au)     Convergence     Time (m)   Iter
-----------------------------------------------------------------------------
Ef      -178.8559653       -1.1286015         0.77E-04        0.221     34

binding energy  -1.128602Ha  -30.71082eV   -708.222kcal/mol   -2963.202kJ/mol
-----------------------------------------------------------------------------

~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ End Computing SCF Energy/Gradient ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~


问题比较多，先问这么多呵呵，谢谢

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-23 at 14:49 ]
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1楼 2009-01-17 14:32:33
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wwj_0905

银虫 (正式写手)
没人知道么
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2楼2009-01-17 15:59:27
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wyl04

金虫 (小有名气)
你问的是什么呢？
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3楼2009-01-18 08:28:35
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wwj_0905

银虫 (正式写手)
Hydrogen     nbas=  1, z=   1, nrfn=  3, rcut=  5.67, e_ref= -0.047605 Ha
   n=1  L=0  occ= 1.00 e=      -0.215484Ha        -5.8636eV
这一整句写的什么？
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4楼2009-01-18 12:23:04
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wwj_0905

银虫 (正式写手)
Energy of Highest Occupied Molecular Orbital  -0.27315Ha    -7.433eV
  HOMO is orbital number    26
  LUMO is orbital number    27
？？
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5楼2009-01-18 12:23:49
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wwj_0905

银虫 (正式写手)
state                         eigenvalue        occupation
                              (au)          (ev)

    1   -   1   a        -24.226977      -659.250     1.000
    2   +   1   a        -24.226972      -659.250     1.000

state 和+ -代表什么啊
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6楼2009-01-18 12:24:31
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wwj_0905

银虫 (正式写手)
df              ATOMIC  COORDINATES (au)                  DERIVATIVES (au)
df            x          y          z            x          y          z
-----------------------------------------------------------------------------
df    H     1.597643   1.720242   1.771919    -0.001540  -0.013177   0.020712

这怎么有两个坐标？？还有DERIVATIVES代表什么啊
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7楼2009-01-18 12:25:21
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
wwj_0905(金币+2):非常感谢 1-18 12:57
wuchenwf(金币+4):xiexie讨论 1-18 21:08
Hydrogen     nbas=  1, z=   1, nrfn=  3, rcut=  5.67, e_ref= -0.047605 Ha
   n=1  L=0  occ= 1.00 e=      -0.215484Ha        -5.8636eV
等等
描述的是你输入得原子轨道基失，并非你的计算结果

Energy of Highest Occupied Molecular Orbital  -0.27315Ha    -7.433eV
  HOMO is orbital number    26
  LUMO is orbital number    27

最HOMO能量是  -0.27315Ha    -7.433eV
第26条轨道是HOMO
第27条轨道是LUMO


    1   -   1   a        -24.226977      -659.250     1.000
    2   +   1   a        -24.226972      -659.250     1.000
+-表示不同自旋方向


df              ATOMIC  COORDINATES (au)                  DERIVATIVES (au)
df            x          y          z            x          y          z
-----------------------------------------------------------------------------
df    H     1.597643   1.720242   1.771919    -0.001540  -0.013177   0.020712

ATOMIC  COORDINATES 才是坐标
DERIVATIVES好像是两步之间得原子位移，这个不一定对，你再验证一下
赞一下(10人) 回复此楼
8楼2009-01-18 12:42:17
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wwj_0905

银虫 (正式写手)
df              ATOMIC  COORDINATES (au)                  DERIVATIVES (au)
df            x          y          z            x          y          z
-----------------------------------------------------------------------------
df    H     1.597643   1.720242   1.771919    -0.001540  -0.013177   0.020712

这个ATOMIC  COORDINATES (au)描述的是什么呢？au不是能量的单位么？
赞一下 回复此楼
9楼2009-01-18 12:58:20
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★
qasd(金币+2):xiexie 1-18 22:47
au 是原子单位制,就像高中学过的国际单位制一样
在量子化学计算中为了避免过多的指数处理而引入了原子单位制
长度的原子单位是波尔
能量的原子单位有的用哈特里有的用里德堡，是二倍关系。
质量的原子单位好像是电子质量
当然还有其他的单位，俺就记不得了
这些单位都可以用a.u.来表示
赞一下(6人) 回复此楼
10楼2009-01-18 22:41:55
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