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【求助】Gaussian优化结构，固定原子的坐标仍改变已有1人参与
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构建Fe-zsm-5模型，在笛卡尔坐标下，所有的H以及与它直接相连的Si和O都固定，保证分子筛的定型，其余保持松弛。固定的方法是将文件中第二列0改为-1。但是进行结构优化后，固定原子的坐标也发生变化，请麻烦解答！ 部分代码如下： %chk=Fe3-zsm-5-5T.chk %mem=512MW %nprocshared=8 # opt freq b3lyp/genecp geom=connectivity SCF=NoVarAcc Title Card Required 0 6 O -1 -4.39113332 2.60368738 3.55359680 O 0 -5.15455332 0.80555558 5.31199640 O -1 -6.91443732 2.46552138 4.28034940 O -1 -5.10231932 3.34386238 5.97435320 O -1 -2.41829532 2.55236858 7.64075880 O -1 -0.77694232 0.49764278 7.63944460 O 0 -5.79743332 0.56475198 7.84840240 O -1 -2.58102432 0.73844638 9.53714940 ...... |
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Yan_Jordan
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【答案】应助回帖
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youfish: 金币+5, ★★★很有帮助, 在计算的时候使用了nosymm，结果中固定原子的坐标保持不变。之前应该是标准坐标在计算中有变化，但实际相对位置没有改变。感谢！ 2017-06-16 09:22:20
youfish: 金币+5, ★★★很有帮助, 在计算的时候使用了nosymm，结果中固定原子的坐标保持不变。之前应该是标准坐标在计算中有变化，但实际相对位置没有改变。感谢！ 2017-06-16 09:22:20
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是的。具体的你可以参考高斯手册中Symmetry的解释 http://gaussian.com/symmetry/ 网上只找到16的，和09的是一样的  |
4楼2017-06-15 14:28:42
Yan_Jordan
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3楼2017-06-15 13:23:01
小小渔yu
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5楼2017-06-20 15:13:33