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2xzxcvbnm

新虫 (著名写手)

[交流] 为什么说引物3'端要避开密码子的第三位?

资料上说因为第三位易发生简并,会影响扩增的特异性和效率。但简并性又和扩增特异性有什么关系呢?为什么会有影响呢?还是不理解。

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2楼2017-05-29 15:56:50
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边木殇

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
2xzxcvbnm: 金币+5 2017-05-30 11:06:26
说白了,引物是由5端开始向3端延伸,3端特异性不高的话,引物和模板贴不到一起,引物很难继续延伸

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2017-05-30 08:55:05
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2xzxcvbnm

新虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 边木殇 at 2017-05-30 08:55:05
说白了,引物是由5端开始向3端延伸,3端特异性不高的话,引物和模板贴不到一起,引物很难继续延伸

谢谢,明白了

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4楼2017-05-30 11:08:05
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鸢尾很辣

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 2xzxcvbnm at 2017-05-30 11:08:05
谢谢,明白了
...

这都能明白?我都看不懂他的意思。。。

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5楼2017-05-30 15:22:24
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D124-91

新虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一般来说,引物的3端要特异性地与模板结合,也因此,通常3端是G或C,如果3端正好是密码子第三位,那发生错配的可能性会比较大,影响特异性扩增。不过,这些理论上的可能性有时候可以不考虑,有时候理论上不够好的引物也可以扩增出好条带

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Inaworld,themisfortuneofyesterdayhasbeenthepast,andthesunwillshineagainafewhourslater.
6楼2017-05-30 15:33:10
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