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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)

[求助] 5'RACE求助 已有2人参与

最近做了一个基因的5'RACE,得到了目的片段,怎么确定它的我要的片段呢?
测序结果找到了引物的序列,但是去blast却和别的基因相似性很高?
怎么确定这个序列是我基因的5’RACE

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十年十天

新虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-05-27 07:39:01
3,5RACE都做下,3端会出现典型polyA加尾信号,5段向前有帽子结构,但是如果括不出来帽子,大约几bpp不出ATG证明你括到头了也可以

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4楼2017-05-23 09:47:04
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Hey Daring

新虫 (正式写手)

7楼2017-05-26 17:05:12
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普通回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-05-23 07:41:31
不能只看引物,要看与你的已知序列是否有重叠区,能不能和你的已知序列拼接上。
2楼2017-05-23 01:23:56
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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2017-05-22 14:23:56
不能只看引物,要看与你的已知序列是否有重叠区,能不能和你的已知序列拼接上。

和我已知的序列对上了。
但是5’这段,blast.结果和我的序列没有同源性,我想知道怎么证明这是段5’UTR

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3楼2017-05-23 09:14:49
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star013

新虫 (知名作家)


我们可以做RACE技术服务,您在需要什么?

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5楼2017-05-23 09:54:45
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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 十年十天 at 2017-05-22 22:47:04
3,5RACE都做下,3端会出现典型polyA加尾信号,5段向前有帽子结构,但是如果括不出来帽子,大约几bpp不出ATG证明你括到头了也可以

谢谢回复。我3'和5'都扩出来片段了,3'没毛病。就是我用5'这段序列去blast,结果和我这个基因没关系,我不知道我扩出来的这个5'是不是我基因的?
6楼2017-05-23 11:21:29
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Hey Daring

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2017-05-23 01:23:56
不能只看引物,要看与你的已知序列是否有重叠区,能不能和你的已知序列拼接上。

关于RACE能不能深入交流下啊

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8楼2017-05-26 23:28:08
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Hey Daring

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 十年十天 at 2017-05-23 09:47:04
3,5RACE都做下,3端会出现典型polyA加尾信号,5段向前有帽子结构,但是如果括不出来帽子,大约几bpp不出ATG证明你括到头了也可以

关于RACE能不能深入交流下啊

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9楼2017-05-26 23:28:20
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MISS.

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2017-05-23 01:23:56
不能只看引物,要看与你的已知序列是否有重叠区,能不能和你的已知序列拼接上。

楼主,最近在做RACE可以交流一下吗
10楼2017-05-31 14:27:59
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