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zhuyuzhu123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 18235149572 at 2017-05-14 00:46:40
两种可能1.过渡态错误。2.加关键词scf=qc试试

过渡态没错,total energy along IRC 是一条向上凸起的曲线,说明过渡态没错,但是我不知道该怎么修改命令能让过渡态跑到反应物和产物。

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11楼2017-05-15 09:03:12
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zhuyuzhu123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 18235149572 at 2017-05-14 00:46:40
两种可能1.过渡态错误。2.加关键词scf=qc试试

不好意思,确实过渡态找错了,过渡态能量比俩个反应物还低。又得重头来了

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12楼2017-05-17 16:29:17
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

从你描述看,你没有找到你要的过渡态,也就是说你认为的过渡态是错的
13楼2017-05-21 06:15:08
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hakuna

木虫 (知名作家)

建议把问题发到GAUSSIAN讨论区,那里人更多,人多力量大
14楼2017-05-21 06:17:17
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zhuyuzhu123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
13楼: Originally posted by hakuna at 2017-05-21 06:15:08
从你描述看,你没有找到你要的过渡态,也就是说你认为的过渡态是错的

我后来又找到了一个过渡态。这个过渡态很奇怪  跟俩个碳相连的氢原子都断了,从有机化学的角度来看,该反应应该是一步的,而且这四个跟碳连接的氢原子与碳原子之间的键不应该断掉的。但是我这个过渡态键是断了的,但是它能量比反应物和产物都高,而且IRC曲线显示也对。但是还是跑不到反应物和产物。我老师说这个反应不是一步反应。后来跟我说就这样吧。就用这个过渡态吧。

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15楼2017-05-21 07:39:53
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zhuyuzhu123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
14楼: Originally posted by hakuna at 2017-05-21 06:17:17
建议把问题发到GAUSSIAN讨论区,那里人更多,人多力量大

谢啦~

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16楼2017-05-21 07:40:10
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hakuna

木虫 (知名作家)

引用回帖:
15楼: Originally posted by zhuyuzhu123 at 2017-05-21 07:39:53
我后来又找到了一个过渡态。这个过渡态很奇怪  跟俩个碳相连的氢原子都断了,从有机化学的角度来看,该反应应该是一步的,而且这四个跟碳连接的氢原子与碳原子之间的键不应该断掉的。但是我这个过渡态键是断了的, ...

你别不高兴,我直接说了,这样是不可以的。
IRC不能连接反应物和产物是不对的,例外情况是分子中个别官能团旋转且旋转能垒极低。
之所以找不到需要的过渡态,首先需要好好考虑一下设计的反应机理是否有问题,是不是合理;其次,你的体系很小,可以做个柔性搜索,看看是否存在过渡态;再者,如果是两个自由基反应,很可能就没有过渡态。

如果仅以一个虚频就认定过渡态,是不够的,弄一个虚频出来太容易了,你把要断的键或要形成的键设定成实际键长的1.2~1.3倍,固定整个键长,然后部分优化,完成后,将优化生成的结构中固定的键解除,算一下频率,大都会得到只有一个虚频的结构,你跑这个结构的IRC,不一定能连接反应物和产物。
从你贴的图看,你的机理应该是分步设计,如果按一步反应考虑,你贴的结构根本不可能是过渡态。
如果考虑是一步完成的,我会考虑如下结构来做猜测的结构:
高斯过渡态跑irc求助

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

17楼2017-05-21 10:42:43
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zhuyuzhu123

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
17楼: Originally posted by hakuna at 2017-05-21 10:42:43
你别不高兴,我直接说了,这样是不可以的。
IRC不能连接反应物和产物是不对的,例外情况是分子中个别官能团旋转且旋转能垒极低。
之所以找不到需要的过渡态,首先需要好好考虑一下设计的反应机理是否有问题,是不 ...

好的,谢谢你。我会再尝试的

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18楼2017-05-21 10:44:18
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zhuyuzhu123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
17楼: Originally posted by hakuna at 2017-05-21 10:42:43
你别不高兴,我直接说了,这样是不可以的。
IRC不能连接反应物和产物是不对的,例外情况是分子中个别官能团旋转且旋转能垒极低。
之所以找不到需要的过渡态,首先需要好好考虑一下设计的反应机理是否有问题,是不 ...

这是我后来找到的过渡态,很奇怪
高斯过渡态跑irc求助-1



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19楼2017-05-21 10:52:01
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hakuna

木虫 (知名作家)

引用回帖:
19楼: Originally posted by zhuyuzhu123 at 2017-05-21 10:52:01
这是我后来找到的过渡态,很奇怪

...

这肯定不是
20楼2017-05-21 10:55:09
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