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四月在七月尾

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by stone2239 at 2017-04-24 11:53:26
选择的序列相似性太高,建树时就是你这样,可以在不同相似性水平选序列重新建树。

嗯嗯,谢谢您

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11楼2017-04-24 12:21:41
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四月在七月尾

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by stone2239 at 2017-04-24 11:53:26
选择的序列相似性太高,建树时就是你这样,可以在不同相似性水平选序列重新建树。

老师您看这样的树能用在论文里吗,这个树是不是就可以用了
blast结果分析,出出来的都是红色的,是哪里出的问题



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12楼2017-04-24 15:08:11
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chenweijlu

铜虫 (小有名气)

你应该是用的原片段吧 不可能起始和结尾都那么一样
13楼2017-04-24 15:11:44
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四月在七月尾

新虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by chenweijlu at 2017-04-24 15:11:44
你应该是用的原片段吧 不可能起始和结尾都那么一样

原片段是什么意思,我不是很明白,您能给我讲讲吗

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14楼2017-04-24 15:18:59
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
14楼: Originally posted by 四月在七月尾 at 2017-04-24 15:18:59
原片段是什么意思,我不是很明白,您能给我讲讲吗
...

楼上说的对,你的序列要截齐后再建树。

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15楼2017-04-24 16:35:14
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四月在七月尾

新虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by stone2239 at 2017-04-24 16:35:14
楼上说的对,你的序列要截齐后再建树。
...

截齐是不是就是做树之前先比对,然后把对不齐的3,端和5,截齐?

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16楼2017-04-24 17:57:38
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合欢花的忧伤

新虫 (著名写手)

引用回帖:
16楼: Originally posted by 四月在七月尾 at 2017-04-24 17:57:38
截齐是不是就是做树之前先比对,然后把对不齐的3,端和5,截齐?
...

比对后剪掉前后

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17楼2017-04-24 22:00:05
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四月在七月尾

新虫 (小有名气)

引用回帖:
17楼: Originally posted by 合欢花的忧伤 at 2017-04-24 22:00:05
比对后剪掉前后
...

嗯嗯

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18楼2017-04-24 22:07:33
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宁文峰

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by 四月在七月尾 at 2017-04-23 21:34:10
做进化树的话出现了这样的结果

...

同源性很高,进化树标尺0.001,除了最下面的独在一个分枝,其他的都差不了多少。。可能只有个别碱基的差异,

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所追求的不在明天,而在现在以前
19楼2017-04-26 07:16:48
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fungijwgg

铁虫 (初入文坛)

没有问题,主要看序列有没有杂合纯合

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20楼2017-04-26 08:16:18
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