24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2519  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhao_shujing

金虫 (小有名气)

[求助] 求助基因家族如何进行引物设计???已有1人参与

我之前克隆了一个基因,引物是老师设计的,这个基因属于一个基因家族,后来老师想让我把这个家族的其他成员全部克隆出来,让我自己设计引物,但由于该家族基因本身相似度就很高了,通过和拟南芥的同源基因比对能比对出一大串,再反过来比对结果又变了,我也不能确定我比对出来的能和拟南芥的哪一个更配对,该怎么办呀?到底是用核酸比对核酸准确?还是蛋白比对核酸准确?求各路大神指教
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhao_shujing

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 青蛙快飞 at 2017-04-15 23:42:17
ncbi blast找到跟拟南芥同源的区段,然后去ucsc浏览器里面选择相应区段就可以看到该区段的所有基因

UCSC网站好像没有植物类的吧,我连拟南芥都没看到。不过很有可能是我没使用过这个网站,所以不会用,找不到在哪,可否请教一下呢?
12楼2017-04-18 20:44:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

jinnini125

木虫 (小有名气)

根据同源序列,用codehop在线设计兼并引物,可同时扩增一个家族的尽可能多的基因。

发自小木虫IOS客户端
2楼2017-04-14 13:25:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

特别喜欢家门口开门的瞬间,宝宝那个高兴呀,蹦蹦跳跳,好不热闹!
3楼2017-04-14 14:50:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhao_shujing

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jinnini125 at 2017-04-14 13:25:52
根据同源序列,用codehop在线设计兼并引物,可同时扩增一个家族的尽可能多的基因。

但是我想知道我克隆的基因对应拟南芥中哪个同源基因呀
4楼2017-04-14 21:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见