应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » Forcite几何优化失败原因求助
212/3返回列表上一页123下一页
查看: 4084  |  回复: 20
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by horhor at 2017-04-11 14:03:41
这个好像没有什么变化

10.jpg
...

把没有优化的 illite-Layer.xsd 以文件的形式发上来，不是截图。
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
11楼2017-04-11 14:26:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

horhor

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-04-11 14:24:41
universal力场，电荷没有forcefield assigned这种方法。...

我的模型没有问题吧？有问题的话应该怎么检查？我是根据别人文献建立的，参数设置在文献里说的不是很细致。
赞一下 回复此楼
12楼2017-04-11 15:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

horhor

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-04-11 14:26:28
把没有优化的 illite-Layer.xsd 以文件的形式发上来，不是截图。...

这个是没有优化的模型
赞一下 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : illite-Layer.xsd
    • 2017-04-11 15:44:26, 467.55 K
13楼2017-04-11 15:44:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
horhor: 金币+20, ★★★很有帮助 2017-04-11 16:50:05
引用回帖:
13楼: Originally posted by horhor at 2017-04-11 15:44:42
这个是没有优化的模型...

已经看过。
你的模型构建可能有问题，Si、O等原子上面都有残键存在，如果要重复文献的结果，首先应保证构建的模型、采用的计算参数设置（力场、计算精度等）跟文献一致。
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
14楼2017-04-11 16:19:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

horhor

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-04-11 16:19:35
已经看过。
你的模型构建可能有问题，Si、O等原子上面都有残键存在，如果要重复文献的结果，首先应保证构建的模型、采用的计算参数设置（力场、计算精度等）跟文献一致。...

周期性的不应该有残键问题吧？charges改成use current后好像能计算了，现在运行到了10万步
赞一下 回复此楼
15楼2017-04-11 16:26:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
15楼: Originally posted by horhor at 2017-04-11 16:26:12
周期性的不应该有残键问题吧？charges改成use current后好像能计算了，现在运行到了10万步...

如果你的模型之前没有给其中的原子指定过电荷，现在电荷按照use current的方式，所有原子的电荷都为0，得到的计算结果肯定不对。
几何优化之后没有其他计算了吗？如果有，没必要把时间浪费在这一步上，你的模型中原子数不多，在参数设置合理的情况下，一般几百步就收敛了，不懂你把收敛精度调那么高、计算步数调到上万级别是为什么。
此外，为什么力场选择universal，除非没有其他机场可以选了，一般都不会用这个力场，因为精度太低，本身力场精度就低，几何优化采用这个力场还要求很高的收敛精度，就没有意义了。
最后，对你的模型，universal和compass两个力场我都用来做几何优化过，步数采用默认的500步，能量降低很明显，都没有报错。我觉得你的模型构建有问题，大量残键存在是不合理的。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
16楼2017-04-11 17:29:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dahamadege

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-04-11 14:24:41
universal力场，电荷没有forcefield assigned这种方法。...

Bingo~
回复此楼
科研小虫，求多指教！
17楼2017-04-11 22:04:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

horhor

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-04-11 17:29:42
如果你的模型之前没有给其中的原子指定过电荷，现在电荷按照use current的方式，所有原子的电荷都为0，得到的计算结果肯定不对。
几何优化之后没有其他计算了吗？如果有，没必要把时间浪费在这一步上，你的模型中原 ...

谢谢您的细心教导和帮助，我用use current后确实计算不对，电能全为0了。还想请教下如何处理残键的问题？
赞一下 回复此楼
18楼2017-04-12 09:21:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

horhor

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-04-11 17:29:42
如果你的模型之前没有给其中的原子指定过电荷，现在电荷按照use current的方式，所有原子的电荷都为0，得到的计算结果肯定不对。
几何优化之后没有其他计算了吗？如果有，没必要把时间浪费在这一步上，你的模型中原 ...

请大师帮我看下我重新建立的模型是不是没有残余键存在了？
赞一下 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : Layer.xsd
    • 2017-04-12 10:33:20, 679.65 K
19楼2017-04-12 10:33:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
19楼: Originally posted by horhor at 2017-04-12 10:33:40
请大师帮我看下我重新建立的模型是不是没有残余键存在了？...

看了下，可能是你的结构的截断比较特殊吧，周期性显示下，边缘的地方还是存在残键。你先计算看看吧。
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
20楼2017-04-12 11:14:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 horhor 的主题更新
212/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 10/500 2026-11-15 02:15 by xSrQNSSjcgoX
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 7/350 2026-11-14 22:44 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-14 21:58 by Equinoxhua
[考博] 27博士 +6 锦鲤送福至 2026-11-10 6/300 2026-11-14 21:23 by xupeii
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-14 13:35 by KXypaGgBBlw7
[考博] 考博求助 10+3 社会实践对别 2026-11-08 3/150 2026-11-13 14:04 by 沐小虫252
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 9/450 2026-11-13 11:02 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 6/300 2026-11-12 12:42 by ECLTXnJnRSXf
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:28 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:33 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 5/250 2026-11-12 11:14 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 7/350 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 09:46 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 08:15 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 04:57 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 17:03 by TgvkbZZl9tqB
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭