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DTCZ

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助诸君,新手TRIzol法提取RNA,RNA浓度太低,纯度也太低,怎么破 已有4人参与

步骤:
1、细胞或组织加 Trizol 后,室温放置 5min,使其充分裂解。
2、12,000rpm 离心 10min,弃沉淀。
3、按 200ul 氯仿/ml Trizol 加入氯仿,上下颠倒混匀后常温放置15min。
4、4℃ 12,000g 离心 15min。
5、吸取上层水相,至另一离心管中
6、按 0.5ml 异丙醇/ml Trizol 加入异丙醇混匀,室温放置10min。
7、4℃ 12,000g 离心 10min,弃上清,RNA 沉于管底。
8、按 1ml 75%乙醇/ml Trizol 加入 75%乙醇,温和振荡离心管,悬浮沉淀。(先加无酶水再加乙醇配置而成,会不会有问题?)
9、 4℃ 8,000g 离心 5min,尽量弃上清。
10、室温晾干或真空干燥 5-10min。注:RNA 样品不要过于干燥,否则很难溶解。
11、用 10ul DEPC水溶解RNA样品。

其中我最后一步用10ul的DEPC水溶解,得到的RNA浓度才90多点ng/ul

浓度也不高,求助诸君啊啊啊

求助诸君,新手TRIzol法提取RNA,RNA浓度太低,纯度也太低,怎么破
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求助诸君,新手TRIzol法提取RNA,RNA浓度太低,纯度也太低,怎么破-1
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feilr

木虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-04-01 07:45:52
我们操作没有你的第二步,然后加水溶解是水会先预热到60度,或者60度孵育两分钟帮助溶解,其他步骤差不多,希望对你有帮助

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16楼2017-04-01 07:07:25
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zhouxiaohan

木虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-04-01 07:44:58
我之前提的都是细胞的,异丙醇离心后如无明显沉淀,说明RNA量很少,你可以提高下你的菌量再试一下。另外,你的260/280值太低,我觉得有可能降解了。

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14楼2017-03-31 22:29:52
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蜜蜡鱼

银虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-04-01 07:45:28
RNA易降解,尽量不要放在常温,放在冰上。另外,异丙醇沉淀的时候,我们实验室是放在-20℃的。

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

15楼2017-04-01 01:29:46
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yun920228

铁杆木虫 (小有名气)

我们提rna用的是试剂盒,最后加的是RNA溶解液,然后55℃左右温育10分钟

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17楼2017-04-01 07:28:26
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mochenmi

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-04-01 07:44:35
有两个问题,第一个是加完异丙醇后离心是否看到明显沉淀?如果有看到沉淀说明rna量是比较多的。第二个是你测浓度的数据中,260/280才1.23,应该是2.0左右,这也可能导致浓度的数据不对。你再重新测一下,如果还是1.23左右,考虑跑个胶看是否降解吧。

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7楼2017-03-30 23:39:46
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mengfanbo

金虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-04-02 08:33:58
我们的方法:第5步之后先加2ul糖原混匀,再进行第6步。第6步里的室温改成-20度静置半小时后再进行下一步。

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18楼2017-04-01 07:52:08
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DTCZ

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
15楼: Originally posted by 蜜蜡鱼 at 2017-04-01 01:29:46
RNA易降解,尽量不要放在常温,放在冰上。另外,异丙醇沉淀的时候,我们实验室是放在-20℃的。

我现在不稀释起始菌液了以后发现浓度提高到了580+和600+,谢谢大神
21楼2017-04-01 20:07:13
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only yoy0

新虫 (小有名气)

加入异丙醇后负20度放置两小时,75%的酒精负20度预冷,最后的DEPC水烘箱预热试试。

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25楼2017-04-02 09:30:46
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普通回帖

DTCZ

铜虫 (小有名气)

1.我除了离心以外都是常温操作,有没有问题?哪些是最好冰上操作?2.我后续又通过试剂盒纯化,但浓度变特别低,各位大佬用TRIzol提细菌RNA有没有纯化?3.我的步骤里面有没有哪个顺序不太合适或者时间不合适?

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2楼2017-03-30 19:55:23
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cuijiaqi_92

铜虫 (小有名气)

什么组织?
山阴路的夏天
3楼2017-03-30 20:35:59
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臭皮匠

新虫 (初入文坛)

可以考虑试剂盒提取
4楼2017-03-30 20:51:57
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liyuan110188

新虫 (初入文坛)

感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 应助指数-1, 无应助 2017-03-30 22:39:42
引用回帖:
2楼: Originally posted by DTCZ at 2017-03-30 19:55:23
1.我除了离心以外都是常温操作,有没有问题?哪些是最好冰上操作?2.我后续又通过试剂盒纯化,但浓度变特别低,各位大佬用TRIzol提细菌RNA有没有纯化?3.我的步骤里面有没有哪个顺序不太合适或者时间不合适?
...

我也是想问,哎,跟你出现了一样的问题

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5楼2017-03-30 20:52:13
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liyuan110188

新虫 (初入文坛)

想问一下,你问题解决了么?

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6楼2017-03-30 21:29:59
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DTCZ

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cuijiaqi_92 at 2017-03-30 20:35:59
什么组织?

细菌
8楼2017-03-31 12:58:14
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DTCZ

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by liyuan110188 at 2017-03-30 21:29:59
想问一下,你问题解决了么?

没有
9楼2017-03-31 12:59:20
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DTCZ

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by mochenmi at 2017-03-30 23:39:46
有两个问题,第一个是加完异丙醇后离心是否看到明显沉淀?如果有看到沉淀说明rna量是比较多的。第二个是你测浓度的数据中,260/280才1.23,应该是2.0左右,这也可能导致浓度的数据不对。你再重新测一下,如果还是1. ...

没有看到明显沉淀,是不是可能因为我的样品稀释了一下?我OD600测的是0.487的样子,然后又稀释了100倍
10楼2017-03-31 13:01:06
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