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大头妞妞

新虫 (小有名气)

[求助] 签了几天的到、终于派上用场了 已有1人参与

从第一次实验到这次实验,参数从未改过、阈值和基线仍是这个鬼样子、想知道具体是怎么回事、可以告诉我吗、protocol是师姐给的、我每一个实验结果看到的阈值都是这样、想知道具体怎么破、谢谢了、下次有金币还会补上

签了几天的到、终于派上用场了


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曙光karry

新虫 (初入文坛)

你换成对数曲线log看看

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-03-31 21:27:44
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

没事不要调阈值,毕竟不是学数学的。
扩增曲线成这样,建议找找自己实验的问题。
Let God do with it as He wills
3楼2017-03-31 22:35:21
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大头妞妞

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 曙光karry at 2017-03-31 21:27:44
你换成对数曲线log看看

嗯、好的、你看看
签了几天的到、终于派上用场了-3



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4楼2017-04-01 14:09:49
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大头妞妞

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by atlanticwi at 2017-03-31 22:35:21
没事不要调阈值,毕竟不是学数学的。
扩增曲线成这样,建议找找自己实验的问题。

请问一下、水你们用的双蒸水还是去离子水、还是说这二者都可以

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5楼2017-04-01 14:10:51
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日光海

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

双蒸水和去离子水都可以,关键在于定量pcr中的baseline一般都是默认生成的,是根据所有监测的反应孔中的荧光强度变化按照默认算法自定的一个阈值。这个是可以手动调的,至少我们实验室当时用的LightCycler480是可以自己手动调整以避开背景反应的干扰的。PCR中,即使不加模板,但由于引物之间会有错误配对,即使不配对的情况,单链引物自身亦是超短模板,标准模板不存在情况下,引物自生的配对扩增会更加频繁,因此引物扩增的超短双联DNA也会产生荧光信号(比如普通PCR中的引物二聚体的产生)。所以你就会看到很多非标准S型曲线的扩增荧光曲线,但机器本身识别不了这个,仍会把这个看作是PCR扩增,所自动生成的baseline会把这一部分荧光强度也算进去。具体的,要做很多优化和分析了,引物设计时一定要避免这个,尤其是在高精度的定量中。
周老湿
6楼2017-11-03 13:23:40
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