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贺夏

金虫 (小有名气)

[求助] 新手做PCR出现问题,请各位大神帮忙解决一下 已有4人参与

用phusion DNA polymerase 做PCR,2kb和1.5kb的片段都没有出来,PCR反应条件:
98℃,30s
98℃,10s
56℃,30s
72℃,1min
72℃,10min
4℃,保存
其中第二步到第四步35个循环
1kb,0.3kb的都有产物,请各位大神帮忙解决一下,谢谢!!!!!

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绝对零度的笑

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-03-04 22:45:58
Phusion用的Tm值可能跟其他引物不太一样,NEB网上有自动计算Tm值的网站,用他们上面算出的Tm值做做看

另外Phusion酶不要超过2U/50ul反应体系

计算Tm值的网站。或者baidu搜索“NEB Tm Calculator”
http://tmcalculator.neb.com/#!/
5楼2017-03-04 09:55:24
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010308Jing

木虫 (正式写手)

有可能退火温度太低了,phusion的退火温度还是要求比较严格的,官网上有计算退火温度的网址

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6楼2017-03-04 14:22:01
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010308Jing

木虫 (正式写手)

还有50微升的体系,只需要0.5微升的酶

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7楼2017-03-04 14:22:39
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xinxiyuzhou

至尊木虫 (著名写手)

延伸时间不够,另外变性温度也要延长,预变性5分钟,循环里面变性30s。祝实验顺利

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8楼2017-03-04 16:19:06
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普通回帖

小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是延伸温度啊,没用过你这个酶,不过一般的酶都是按1min1000bp来算
···
2楼2017-03-04 09:14:31
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3楼2017-03-04 09:34:53
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sky蒲公英

版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
模板是cDNA吗?加的量多少?用其他的聚合酶是否试过?

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知识就像蒲公英的花儿一样,播种在世界的每一个角落。
4楼2017-03-04 09:36:25
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贺夏

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sky蒲公英 at 2017-03-04 09:36:25
模板是cDNA吗?加的量多少?用其他的聚合酶是否试过?

模板就是DNA,用TAQ酶的话,2KB的和1.5KB的都有产物

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9楼2017-03-04 18:16:59
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贺夏

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 010308Jing at 2017-03-04 14:22:39
还有50微升的体系,只需要0.5微升的酶

我确实只用了0.5微升的酶

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10楼2017-03-04 18:17:50
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