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薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)

[交流] 有谁会用MEGA做基因组合分析构建树图的吗已有4人参与

我刚刚上手这个软件,目前只会简单的多序列构建树图,我目前手上有昆虫18S  28S  和COI的基因,想联合这3个基因做一个组合聚类分析构建一个系统发育图,看亲缘关系。但是不太会做组合聚类的分析。百度的教程也只有多序列分析,谁能教我一下吗。
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xtgojian72

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
就在文本文件上,一个接一个就是啊

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11楼2017-03-02 21:12:46
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xtgojian72

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-02-26 08:57:17
先分别将三个基因构建进化树。构建进化树时,每个基因所选的参考菌株均为模式菌株,而且建树的所有菌株必须比对后两端进行人工校正。然后,将校正后的同一菌种的三个基因按相同的顺序拼接,再构建进化树。OK?

发自小木虫Android客户端
2楼2017-02-26 06:05:16
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xtgojian72

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
且建树的所有菌株的基因序列必须比对后两端进行人工校正。

发自小木虫Android客户端
3楼2017-02-26 06:07:19
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薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-02-26 06:05:16
先分别将三个基因构建进化树。构建进化树时,每个基因所选的参考菌株均为模式菌株,而且建树的所有菌株必须比对后两端进行人工校正。然后,将校正后的同一菌种的三个基因按相同的顺序拼接,再构建进化树。OK?
...

是不是就是,列如先把18S和28S的分别用mega构树,然后保存序列,在用保存的序列进行拼接,拼接的结果再来构树~
4楼2017-02-26 16:53:12
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