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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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IRIS999

铁虫 (正式写手)

[求助] Forcite 几何优化有机小分子 已有1人参与

小白刚开始学习MS,目标是用MS算有机小分子的溶解度参数
在结构优化一步就被卡了好久,用amorphous cell构建了包含50个小分子的盒子,其中number of configurations用了默认的10
然后用Forcite做几何优化,能量图的X轴竟然是frame,只从1走到10,我想大概是算每个构型的能量吧,可是x轴不应该是优化步数吗?
为何优化一个小分子的时候X轴就是优化步数呀?优化盒子和小分子参数设置变化很大吗?
研究了MS8.0→Forcite→Calculation→Geometry Optimization里面所有需要设置的地方以及help里面都看不到涉及这个问题的解释,求大神给看看
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复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
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IRIS999

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-02-21 19:36:34
不显示后缀名的问题,要设置你的操作系统,在文件夹选项里,选择显示所有的已知文件类型,具体可以百度。
...

又继续搜了Forcite相关信息,有同学说是只有Forcite里面有anneal和conhesion energy density等等就算是Forcite Plus了,不一定出现名字叫“Forcite Plus”的module,对吧
复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
8楼2017-02-23 13:41:03
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查看全部 12 个回答

IRIS999

铁虫 (正式写手)

之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的,X轴是步数
但是装了MS8.0,听说Discover全部并入Forcite了,所以用了Forcite里面的Geometry Optimization,结果能量图的X轴变成了frame
复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
2楼2017-02-21 14:00:06
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
IRIS999: 金币+8, ★★★★★最佳答案, 非常感谢,完美解决 2017-02-21 19:27:15
amorphous cell构建得到的xtd文件,打开,选择其中任一构型,复制该构型,然后粘贴到一个新建的xsd文件中,再对xsd文件做几何优化。
不要直接对xtd类型的结构做几何优化。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2017-02-21 16:23:14
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by IRIS999 at 2017-02-21 14:00:06
之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的,X轴是步数
但是装了MS8.0,听说Discover全部并入Forcite了,所以用了Forcite里面的Geometry Optimization,结果能量图的X轴变成了frame

在有了Forite模块之后,Discover模块已经是鸡肋,8.0之后移除了Discover模块。
Forcite里面的Geometry Optimization没问题,是你操作的问题。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2017-02-21 16:25:54
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