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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 软件使用与操作 » Forcite 几何优化有机小分子
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IRIS999

铁虫 (正式写手)

[求助] Forcite 几何优化有机小分子已有1人参与

小白刚开始学习MS，目标是用MS算有机小分子的溶解度参数
在结构优化一步就被卡了好久，用amorphous cell构建了包含50个小分子的盒子，其中number of configurations用了默认的10
然后用Forcite做几何优化，能量图的X轴竟然是frame，只从1走到10，我想大概是算每个构型的能量吧，可是x轴不应该是优化步数吗？
为何优化一个小分子的时候X轴就是优化步数呀？优化盒子和小分子参数设置变化很大吗？
研究了MS8.0→Forcite→Calculation→Geometry Optimization里面所有需要设置的地方以及help里面都看不到涉及这个问题的解释，求大神给看看
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复杂只是一种雾霭，有了阳光，它便消散。
1楼2017-02-21 13:37:39
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IRIS999

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-02-21 19:36:34
不显示后缀名的问题，要设置你的操作系统，在文件夹选项里，选择显示所有的已知文件类型，具体可以百度。
...

又继续搜了Forcite相关信息，有同学说是只有Forcite里面有anneal和conhesion energy density等等就算是Forcite Plus了，不一定出现名字叫“Forcite Plus”的module，对吧
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复杂只是一种雾霭，有了阳光，它便消散。
8楼2017-02-23 13:41:03
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IRIS999

铁虫 (正式写手)
之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的，X轴是步数
但是装了MS8.0，听说Discover全部并入Forcite了，所以用了Forcite里面的Geometry Optimization，结果能量图的X轴变成了frame
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复杂只是一种雾霭，有了阳光，它便消散。
2楼2017-02-21 14:00:06
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
IRIS999: 金币+8, ★★★★★最佳答案, 非常感谢，完美解决 2017-02-21 19:27:15
amorphous cell构建得到的xtd文件，打开，选择其中任一构型，复制该构型，然后粘贴到一个新建的xsd文件中，再对xsd文件做几何优化。
不要直接对xtd类型的结构做几何优化。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
3楼2017-02-21 16:23:14
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by IRIS999 at 2017-02-21 14:00:06
之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的，X轴是步数
但是装了MS8.0，听说Discover全部并入Forcite了，所以用了Forcite里面的Geometry Optimization，结果能量图的X轴变成了frame

在有了Forite模块之后，Discover模块已经是鸡肋，8.0之后移除了Discover模块。
Forcite里面的Geometry Optimization没问题，是你操作的问题。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2017-02-21 16:25:54
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