24小时热门版块排行榜    

查看: 3614  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

IRIS999

铁虫 (正式写手)

[求助] Forcite 几何优化有机小分子 已有1人参与

小白刚开始学习MS,目标是用MS算有机小分子的溶解度参数
在结构优化一步就被卡了好久,用amorphous cell构建了包含50个小分子的盒子,其中number of configurations用了默认的10
然后用Forcite做几何优化,能量图的X轴竟然是frame,只从1走到10,我想大概是算每个构型的能量吧,可是x轴不应该是优化步数吗?
为何优化一个小分子的时候X轴就是优化步数呀?优化盒子和小分子参数设置变化很大吗?
研究了MS8.0→Forcite→Calculation→Geometry Optimization里面所有需要设置的地方以及help里面都看不到涉及这个问题的解释,求大神给看看
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

IRIS999

铁虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-02-21 19:36:34
不显示后缀名的问题,要设置你的操作系统,在文件夹选项里,选择显示所有的已知文件类型,具体可以百度。
...

非常感谢,是否能再问一个关于MS8.0的问题?
Help里面说Forcite Plus需要另外的License,我装MS8.0时只install了一个license,然后我的界面只有Forcite,一直以为我没有Forcite Plus,
可是我看创腾的PPT上面讲Forcite Plus时界面和我的Forcite是一样的,唯一不同的一点是计算cohesion energy density时创腾的介绍页面显示more里面有三个选项卡,我的MS里面只有一个,那我能问个小白问题,我到底有没有Forcite Plus吗? 我需要算cohesion energy density
Forcite 几何优化有机小分子
1.jpg


Forcite 几何优化有机小分子-1
2.jpg

复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
7楼2017-02-23 13:30:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

IRIS999

铁虫 (正式写手)

之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的,X轴是步数
但是装了MS8.0,听说Discover全部并入Forcite了,所以用了Forcite里面的Geometry Optimization,结果能量图的X轴变成了frame
复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
2楼2017-02-21 14:00:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
IRIS999: 金币+8, ★★★★★最佳答案, 非常感谢,完美解决 2017-02-21 19:27:15
amorphous cell构建得到的xtd文件,打开,选择其中任一构型,复制该构型,然后粘贴到一个新建的xsd文件中,再对xsd文件做几何优化。
不要直接对xtd类型的结构做几何优化。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2017-02-21 16:23:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by IRIS999 at 2017-02-21 14:00:06
之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的,X轴是步数
但是装了MS8.0,听说Discover全部并入Forcite了,所以用了Forcite里面的Geometry Optimization,结果能量图的X轴变成了frame

在有了Forite模块之后,Discover模块已经是鸡肋,8.0之后移除了Discover模块。
Forcite里面的Geometry Optimization没问题,是你操作的问题。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2017-02-21 16:25:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +5 瞬息宇宙 2026-08-12 5/250 2026-08-13 07:13 by athenadai219
[基金申请] FileCode能看出啥? +8 要乐观耀哥 2026-08-10 23/1150 2026-08-13 00:35 by 要乐观耀哥
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] 长年满屏的广告,版主太不责任了。基金也等的急 +4 gltch 2026-08-12 4/200 2026-08-12 16:08 by eulota
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
信息提示
请填处理意见