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forget1997

银虫 (小有名气)

[交流] 酶切、连接、转化求助

我计划用双酶切我的PCR产物,和pGL3质粒,然后转化大肠杆菌JM109.如果顺利,转染重组质粒进入HepG2细胞。我有如下问题请教大家:
(1)PCR之后、酶切之前,是否要胶回收、或者清洗PCR产物?
(2)酶切的时候,要加多少单位的酶?我准备用50ul体系。
(3)两种酶可以用同一种buffer。我可否将两种酶同时加入?
(4)T4连接的时候,要加多少单位的酶?
(5)连接之后,是否要提纯质粒,然后转化?
(6)转染HepG2细胞,那种kit比较合适?
(7)转染一般多少次重复?
(8)转染细胞应该在单个的10cm的plate里培养,还是6-well 里面培养?是不是6-well的plate会好点、更均一一些?
(9) HepG2等贴壁细胞,分瓶之前培养基是否要37°预热?

Thanks!

[ Last edited by forget1997 on 2008-12-18 at 14:07 ]
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yhxiang

金虫 (小有名气)


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~
(1)酶切前后都要 胶回收
(2)0.5ul
(3)可以
(4)1ul Takara的T4连接酶
(5)连接之后直接转化,不需要纯化
(6)(7)98)我没做过,
向往从容淡定的生活
2楼2008-12-18 14:13:21
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suguang

铜虫 (初入文坛)

★ ★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~
lwf991229(金币+1,VIP+0):3Q~
(1)PCR之后、酶切之前,是否要胶回收、或者清洗PCR产物?  要
(2)酶切的时候,要加多少单位的酶?我准备用50ul体系。     按酶的活性单位和你酶切产物的量,适当加大用量或酶切时间
(3)两种酶可以用同一种buffer。我可否将两种酶同时加入?  参考酶公司提供的目录上的双酶切使用Buffer列表
(4)T4连接的时候,要加多少单位的酶?  按各个酶的说明书,可适当加大酶量和连接时间
(5)连接之后,是否要提纯质粒,然后转化?  一般不需要纯化,连接产物直接可以转化,也可以醇沉后转化
3楼2008-12-18 14:17:13
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bbyu007

木虫 (正式写手)

★ ★
lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~
lwf991229(金币+1,VIP+0):3Q~
我们做的过程前面差不多,只能回答你前4步,仅供参考:
(1)PCR之后、酶切之前   这之间要有不少工作要做。首先,回收pcr产物,然后将其连T载体。因为只有从T载体切下来的目的片段才有粘性末端,才能继续下一步的连接等工作。其次,蓝白斑选择,挑小的白斑,摇菌,做菌落pcr,挑正确的菌落后,提去质粒DNA,做酶切跑胶验证,验证正确后,送测序,测序正确后可以酶切,连接了。
(2)酶切用50 ul可以。2种酶均加1.5 ul即可。
(3)加0.5 ul。
(4)不用提纯,直接转化。
以下请高手继续解答。
我是笨笨鱼~~~
4楼2008-12-18 14:22:49
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bbyu007

木虫 (正式写手)

我们做的过程前面差不多,只能回答你前4步,仅供参考:
(1)PCR之后、酶切之前   这之间要有不少工作要做。首先,回收pcr产物,然后将其连T载体。因为只有从T载体切下来的目的片段才有粘性末端,才能继续下一步的连接等工作。然后,蓝白斑选择,挑小的白斑,摇菌,做菌落pcr,挑正确的菌落后,提取质粒DNA,做酶切跑胶验证,验证正确后,送测序,测序正确后可以酶切,连接了。
(2)酶切用50 ul可以。2种酶均加1.5 ul即可。
(3)可以。
(4)加0.5 ul。
(5)不用提纯,直接转化。
以下请高手继续解答。
我是笨笨鱼~~~
5楼2008-12-18 14:26:03
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


forget1997(金币+1,VIP+0):3Q!
(6)转染HepG2细胞,那种kit比较合适?-------Invitrogen的lipo 2000咯,很经典,HepG2还是可以用这个转的
(7)转染一般多少次重复?--------24孔设3个复孔,96孔至少6个
(8)转染细胞应该在单个的10cm的plate里培养,还是6-well 里面培养?是不是6-well的plate会好点、更均一一些?----------24孔都可以,看你要做的下游实验是什么。western的话60皿,纯看形态24孔板
(9) HepG2等贴壁细胞,分瓶之前培养基是否要37°预热?---------绝对要!无论做什么操作,如传代、换液等,都要预热培养基
6楼2008-12-18 18:12:49
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

(2)酶切的时候,要加多少单位的酶?我准备用50ul体系。
-------以上所有答多少ul的酶的答案都是不到位的。按照NEB的体系,50ul一般需要2个单位内切酶。这里的50ul是含有≤2ug的质粒DNA。根据酶活定义,一小时消化1ug DNA为一个单位。

(4)T4连接的时候,要加多少单位的酶?
-----------同(2),是需要根据酶活定义来看的。建议使用快速连接kit

(5)连接之后,是否要提纯质粒,然后转化?
-----------化学感受态是不需要的

这里的任何一种工具酶都不要用takara的。内切酶星号活性严重,酶活低,T4酶活也很低。
7楼2008-12-18 18:18:28
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1yangz

新虫 (初入文坛)


真是很受帮助
小虫初来!
谢谢!
8楼2008-12-18 20:31:48
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mixy

铜虫 (初入文坛)

takara的内切酶还好,酶切效率挺不错的,就是千万不要加太多了,50ul的体系双酶切每种酶加1ul即可,不可过多。连接酶,takara的效率不是很高,建议用全氏金的,10分钟即可连接完成。
9楼2009-01-07 01:23:14
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study236

银虫 (小有名气)

谢谢各位了,我也学习学习
10楼2009-01-08 13:50:21
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