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ljylhy

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问大型真菌做荧光定量pcr应该选取那种内参？

新手第一次做荧光定量pcr，想请问各位大神，大型真菌可选用的荧光定量pcr内参有哪些？β-actin和NADPH可以用吗？我自己查阅的资料说使用18sr rna，但是找不到相应的引物，请各位大神指点迷津。
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1楼 2017-02-11 20:44:50
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seascen2016

新虫 (小有名气)
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-02-12 00:42:31
actin tublin都行，可以自己设计引物啊

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2楼2017-02-11 22:16:42
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ljylhy

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by seascen2016 at 2017-02-11 22:16:42
actin tublin都行，可以自己设计引物啊

β-actin的引物序列是在线查询然后自己设计吗？还有别的可选的内参吗？
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3楼2017-02-13 11:43:07
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seascen2016

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ljylhy at 2017-02-13 11:43:07
β-actin的引物序列是在线查询然后自己设计吗？还有别的可选的内参吗？...

对的，tublin也可以的

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4楼2017-02-13 21:21:46
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ljylhy

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by seascen2016 at 2017-02-13 21:21:46
对的，tublin也可以的
...

还请问您一个问题，我做的这个种，目前没有他的β-actin以及tublin的基因相关信息，但是有同一个属的菌的相关信息，这种情况该怎么处理？是用近似属的序列进行设计，还是使用更保险的18s rrna序列。
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5楼2017-02-16 19:35:31
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seascen2016

新虫 (小有名气)
选18s rRNA靠谱

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6楼2017-02-16 20:04:18
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和小若

新虫 (初入文坛)
亲，你的内参最后确定了吗 ?用18S了吗？你做的是什么菌，我最近也在选大型真菌的内参，GAPDH扩不出来。
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7楼2017-08-14 12:14:04
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