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ljylhy

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问大型真菌做荧光定量pcr应该选取那种内参?

新手第一次做荧光定量pcr,想请问各位大神,大型真菌可选用的荧光定量pcr内参有哪些?β-actin和NADPH可以用吗?我自己查阅的资料说使用18sr rna,但是找不到相应的引物,请各位大神指点迷津。
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seascen2016

新虫 (小有名气)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2017-02-12 00:42:31
actin tublin都行,可以自己设计引物啊

发自小木虫Android客户端
2楼2017-02-11 22:16:42
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ljylhy

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by seascen2016 at 2017-02-11 22:16:42
actin tublin都行,可以自己设计引物啊

β-actin的引物序列是在线查询然后自己设计吗?还有别的可选的内参吗?
3楼2017-02-13 11:43:07
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seascen2016

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ljylhy at 2017-02-13 11:43:07
β-actin的引物序列是在线查询然后自己设计吗?还有别的可选的内参吗?...

对的,tublin也可以的

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4楼2017-02-13 21:21:46
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ljylhy

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by seascen2016 at 2017-02-13 21:21:46
对的,tublin也可以的
...

还请问您一个问题,我做的这个种,目前没有他的β-actin以及tublin的基因相关信息,但是有同一个属的菌的相关信息,这种情况该怎么处理?是用近似属的序列进行设计,还是使用更保险的18s rrna序列。
5楼2017-02-16 19:35:31
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seascen2016

新虫 (小有名气)

6楼2017-02-16 20:04:18
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和小若

新虫 (初入文坛)

亲,你的内参最后确定了吗 ?用18S了吗?你做的是什么菌,我最近也在选大型真菌的内参,GAPDH扩不出来。
7楼2017-08-14 12:14:04
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