24小时热门版块排行榜    

查看: 929  |  回复: 16

二十一业

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的这个问题是表面问题,所谓16S同源性,那你将两个16S序列blast一下完事。
但我认为你想得到的是这两个菌株的同源性,这里就涉及到为何做同源性,需要解决具体什么层面的同源性问题,然后选取相应的方法解决。
11楼2017-01-20 17:33:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

党佳佳

新虫 (初入文坛)

就是两个菌属于同一属,具有相同的功能,然后找它的同源性

发自小木虫Android客户端
12楼2017-01-20 18:50:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sqc88686

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by 党佳佳 at 2017-01-20 18:50:48
就是两个菌属于同一属,具有相同的功能,然后找它的同源性

其实不是很明白你的意思?序列的同源blast就可以了。菌珠的话,snp,pfge,mlst都可以说明问题

发自小木虫Android客户端
13楼2017-01-25 09:03:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cedar

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
homology和similarity不是完全相同的概念,一般论文李16s rna基因序列的相似性结果是pairwise similarity.

发自小木虫Android客户端
14楼2017-01-28 20:25:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cedar

新虫 (小有名气)

15楼2017-01-28 20:28:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cedar

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
15楼: Originally posted by cedar at 2017-01-28 20:28:45
gap

计算同源性时gap
是全部去掉的

发自小木虫Android客户端
16楼2017-01-28 20:29:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬草的味d

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
16楼: Originally posted by cedar at 2017-01-28 20:29:20
计算同源性时gap
是全部去掉的
...

用什么软件可以做同源性的图呢

发自小木虫Android客户端
17楼2017-03-02 17:16:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 党佳佳 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271材料工程求调剂 +4 .6lL 2026-03-18 4/200 2026-03-18 20:05 by 楤哥
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 9/450 2026-03-18 15:31 by vgtyfty
[考研] 311求调剂 +6 26研0 2026-03-15 6/300 2026-03-18 14:43 by haxia
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +8 Ncdx123456 2026-03-13 9/450 2026-03-18 14:40 by haxia
[考研] 0703化学调剂 +4 pupcoco 2026-03-17 7/350 2026-03-18 12:14 by djl2006
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +6 困于星晨 2026-03-17 6/300 2026-03-18 10:21 by kkcoco25
[考研] 301求调剂 +9 yy要上岸呀 2026-03-17 9/450 2026-03-18 08:58 by 无际的草原
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:27 by Little-xue
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +16 不知道叫什么! 2026-03-15 18/900 2026-03-17 17:05 by ruiyingmiao
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
信息提示
请填处理意见