24小时热门版块排行榜    

查看: 1477  |  回复: 11
【悬赏金币】回答本帖问题,作者0220zy将赠送您 88 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

0220zy

新虫 (初入文坛)

[求助] 小鼠抗体重链的引物无法扩增出目的基因,急求解决方案已有2人参与

从文献中找的小鼠抗体重链的引物3条,找生工进行合成。Taq聚合酶是Takara的普通的,不是高保真的。

轻链一次就扩增出目的基因,重链一直扩增不出来。尝试了好多退火温度(55.58.60.62 结果如图.),延伸温度72,延伸时间42s和1min20s,循环数在30和35,电泳显示二聚体很多。

变性94℃30s,退火不同温度都是30s,延伸72℃有42s有1min20s的,循环30次的和35次的

现在怀疑是不是引物有问题,因为不是自己设计的,硕士论文中的重复性应该不高。
用cDNA模板跑内参引物,效果很好,条带很清晰很亮,模板应该没有问题。
看电泳图有些能隐约看到700bp处出来了条带,但是都不是很明显。

重链5‘Tm值61.56,GC为59.09;
重链3’第一条引物  Tm值62.70,GC为46.67
重链3’第二条引物  Tm值65.35,GC为59.26
重链3’第三条引物  Tm值63.07,GC为53.33

真的不知道该怎么办了。求大神支招啊,建议怎么设计反应条件!!!不胜感激

小鼠抗体重链的引物无法扩增出目的基因,急求解决方案
1.jpg


小鼠抗体重链的引物无法扩增出目的基因,急求解决方案-1
2.jpg


小鼠抗体重链的引物无法扩增出目的基因,急求解决方案-2
3.jpg


小鼠抗体重链的引物无法扩增出目的基因,急求解决方案-3
4.jpg@youlinglyw@wizardfan
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0220zy

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yt7777 at 2017-01-18 01:17:10
建议楼主做个梯度吧,Tm最低设定50℃,另外有可能是引物浓度高。。。

你说的梯度是touchdown 么?实验室没有条件做梯度,只是最普通的pcr仪。
引物浓度确实有点高,是10uM,我准备再稀释,变成1uM,试试。

发自小木虫Android客户端
3楼2017-01-18 08:05:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

yt7777

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议楼主做个梯度吧,Tm最低设定50℃,另外有可能是引物浓度高。。。
2楼2017-01-18 01:17:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jurkat.1640

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的样品取自什么组织和细胞,引物是针对哪部分啊?
4楼2017-01-18 10:02:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yt7777

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 0220zy at 2017-01-18 08:05:30
你说的梯度是touchdown 么?实验室没有条件做梯度,只是最普通的pcr仪。
引物浓度确实有点高,是10uM,我准备再稀释,变成1uM,试试。
...

是的,普通的pcr仪应该也可以,自己写个程序。。。

发自小木虫IOS客户端
5楼2017-01-18 12:21:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 硕博巨婴,也许才刚刚开始 +29 SNaiL1995 2024-06-12 64/3200 2024-06-16 01:21 by 欢喜1998
[教师之家] 请问事业编制和年薪制冲突吗? +6 ZHONGWU_U 2024-06-14 6/300 2024-06-15 20:16 by Ermito
[基金申请] 博士后创新人才支持计划公示 +9 aishida144 2024-06-14 13/650 2024-06-15 19:18 by 默默挥手
[考博] 34岁读博士晚吗 +25 emitdne 2024-06-13 25/1250 2024-06-15 16:27 by wubo6066233
[教师之家] 饶议:什么制度能保障大学普通教师不用为领导拎包,不用看领导脸色 +8 zju2000 2024-06-12 14/700 2024-06-15 13:59 by chemhua
[考博] 2025考博 +4 自强不息a?a 2024-06-15 6/300 2024-06-15 12:36 by 自强不息a?a
[论文投稿] 投稿时忘记修改一作 +7 gll123456 2024-06-13 11/550 2024-06-15 11:49 by gll123456
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+3 迷茫小旷 2024-06-14 4/200 2024-06-15 11:25 by bobvan
[找工作] 杭电、天津科技、青农和宁波工程学院如何选? +9 味道很好啊 2024-06-13 15/750 2024-06-15 09:59 by yulan19992002
[硕博家园] 竟然失眠了 +10 zmr8 2024-06-09 10/500 2024-06-15 09:54 by tjushede
[食品] 食品博士导师 +6 小李醒yy 2024-06-11 9/450 2024-06-14 23:37 by 小李醒yy
[基金申请] 工材E口JQ有消息了吗 +4 babyduck 2024-06-11 4/200 2024-06-14 17:23 by firepick
[硕博家园] 关于硕博连读的一些疑问? +4 Lwenter 2024-06-14 4/200 2024-06-14 14:32 by ou0551
[有机交流] ππ堆积会发生在有机溶剂中吗 5+3 zibuyu0420 2024-06-13 4/200 2024-06-14 14:17 by 小肉干
[基金申请] 国自然基金公布的时候基金号有吗 +8 潇洒怡惜 2024-06-13 11/550 2024-06-14 11:24 by JRfei
[论文投稿] 最近写了一篇控制优化领域的文章,可以投哪里啊?有没有水一些的期刊推荐 +7 香瓜木香 2024-06-12 13/650 2024-06-14 07:05 by 香瓜木香
[基金申请] C口食品 +6 好好不过分 2024-06-09 19/950 2024-06-13 12:26 by zydemon525
[找工作] 成都产品质量检测研究院 200+3 鲸鱼663 2024-06-11 8/400 2024-06-13 08:10 by 加纳居士
[基金申请] 博后特助这周出结果吗?往年都是啥时候啊? +13 jsqy 2024-06-12 17/850 2024-06-12 19:55 by Lynn212
[硕博家园] 求助 +6 LYWwrz 2024-06-09 9/450 2024-06-11 13:12 by powerhours
信息提示
请填处理意见