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关于测序的几个问题
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梦幻在玩
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[交流]
关于测序的几个问题
就是一段2000bp的序列,已经连在了pbs载体上。序列基本是已知的就是为了验证一下顺便看看有没有突变之类的。学姐说现在的那个公司的测序宣传是800,实际可信的就只有600多bp。几个问题是酱紫
1,两端的测序引物似乎是公司提供的存在于载体上的引物?这是不是意味着序列的两端都是可信的,不存在引物后面一段测不准的情况呢
2,同上,如果两端的引物是在载体上,我当初扩增这段序列用的引物(还加上了保护碱基和酶切位点)就没用啦?
3,那我大概需要新设计几个测序引物呢?位置在哪里比较合适哦
刚从实验室出来,晚上想问问公司的人明天回去再和学姐多交流下,现在坐在通勤上脑袋有点晕,希望大家能帮我理一下思路。。。
补充:看了下测序公司的引物,两端分别是T7和T3。那个这俩我在数据库上看到,他们被标为promoter啊,数据库里有其他的比如M13都被标为primer.这是这俩能够当引物用的意思吗?
发自小木虫Android客户端
[
Last edited by 梦幻在玩 on 2017-1-14 at 18:51
]
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引用回帖:
18楼
:
Originally posted by
gyesang
at 2017-01-15 04:00:51
1,两端的测序引物似乎是公司提供的存在于载体上的引物?这是不是意味着序列的两端都是可信的,不存在引物后面一段测不准的情况呢
你学姐说的是对的,一般双脱氧测序可以测1000bp 左右,前600-800bp 是准确的,后面 ...
好哦好哦
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22楼
2017-01-15 10:34:36
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l651240
12楼
2017-01-14 18:56
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梦幻在玩(金币+2): 谢谢参与
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