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h_qiang

新虫 (初入文坛)

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专业: 生物信息学

[交流] 求教测序reads拼接不全的文件，怎么做进化树呢？已有2人参与

比如10 株细菌的全基因组重测序reads拼接完成后，得到如下格式文件：

>NODE_1
ATCATCATCTAC
>NODE_2
CCTAATATCCCTATA

这样的十个文件，每个菌株的序列都不是测通的，每个菌株的序列都拥有一个独立的文件。

请问各位前辈，我如果做进化树的话，应该怎么处理这些文件呢，是需要用什么方法将它连贯起来，还是这种不测通的就能直接做。希望详细一些~万分感谢！

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1楼 2017-01-12 09:58:55

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baichi121234

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

2楼2017-01-12 15:14:03

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Rdan

新虫 (小有名气)

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专业: 生物大分子结构与功能

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

如果公司没有拼接的话，就需要自己去拼接这些序列，检查是否测通了。如果没有，再和公司沟通看是补测还是怎么办？

发自小木虫Android客户端

3楼2017-01-12 23:42:57

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h_qiang

新虫 (初入文坛)

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专业: 生物信息学

引用回帖:

2楼: Originally posted by baichi121234 at 2017-01-12 15:14:03
重测

万分感谢

4楼2017-01-16 10:11:30

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