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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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jianjunjiang

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] gromacs pull 参数的使用

各位专家:
                 我现在使用gromacs中pull 的恒力牵引,具体参数如下
pull                     = constant_force
pull-geometry              = direction-periodic
pull-coord1-groups       =1
pull_coord1_dim         = N N Y
pull_coord1_vec          = 0 0 -1
pull_ngroups             = 1
pull_group1_name              =a_29721-31280
pull_coord1_k                  = 2.4364

可是在grompp时出现了一个错误ERROR: pull-coord1-groups should have 2 components

但是在mdrun时,却能运行,不知是何道理
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

系统自动识别
这个运动是相对的,你说要把他往下拉,你这个位置是相对于谁往上拉吗?就是这个轱辘比一合股不二。


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5楼2017-01-09 19:43:08
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

就是将group1group2拉开or拉近

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-01-09 17:13:59
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jianjunjiang

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2017-01-09 17:13:59
就是将group1group2拉开or拉近

谢谢您的答复,我现在是想利用一个恒力将group1向下平移
3楼2017-01-09 18:24:48
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jianjunjiang

铁杆木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2017-01-09 17:13:59
就是将group1group2拉开or拉近

不知道这个error会不会影响计算结果
4楼2017-01-09 18:28:56
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