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质粒测序结果不会分析已有3人参与
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大四学生，毕业论文实验是提细菌质粒，生科公司发来了测序结果，没有学过生物信息学，所以不会分析结果。请问各位有没有好的学习网站或者资料推荐 @biostar2009 @wizardfan @youlinglyw 发自小木虫IOS客户端 |
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
xn8008: MolEPI+1, 给予MolEPI 2017-01-09 09:37:23
xn8008: MolEPI+1, 给予MolEPI 2017-01-09 09:37:23
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分析有几个步骤： 1：你得在网上找个DNAstar装上，一般我们分析测序结果都用这个软件。主要是里面的seqman 2：打开公司发给你的测序结果，一般都是压缩文件，最好用里面的ABI格式的文件，方便看峰图。 3：如果你有标准序列就把你的便准序列放到TXT文档里面，再把测序结果和标准序列一起放到seqman比对，这样就找到你的侧学结果了。 4：看你是质粒测序，要先把载体部分删掉。这样比对文件就做好了。 5：至于分析，最简单的你可以把你的目的片段放在NCBI的BLAST中比对（https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）；看你的序列是不是你想要的东西，如果是全长基因也可以先翻译成蛋白再找。（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/） 6：至于继续分析也无非是看看碱基分布，找找启动子，酶切位点，预测下磷酸化位点，翻译成蛋白甚至做出他的3D结构什么的，不过对于一个大四的来说，没必要这么复杂。你随便找篇类似的中文文章看看一，分析的类型就都知道了。 |
欲小岳岳
4楼2017-01-08 09:00:41
小冀-
版主 (著名写手)
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- 专业: 生物信息学
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2楼2017-01-07 20:55:27
3楼2017-01-07 20:57:04
5楼2017-01-08 09:17:31