24小时热门版块排行榜    

查看: 1805  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhangdie

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问验证cds全长序列设计引物(cDNA模板),后二十碱基几乎没有GC怎么办

为了设计这个引物我查了好多资料,pp5也下了学了但是验证cds的引物基本上只有前二十和后二十这种设计法,但我下游引物用了最后二十四个碱基CG含量才大概20%,退火温度五十都不到,跑出条带做了连接转化但结果都不是目的基因。有人说用utr区设计,但是我5‘utr只有十五个已知碱基,是需要先做个5race吗?或者前辈们有什么别的方法?求指点谢谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangdie

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by MAS_rice at 2017-01-03 23:20:27
能扩出来应该可以用吧,要不然你把这个扩出来的前段连个T载,再测序看看是不是目的前段

做过了,挑了十个菌都出了结果位置和我目的条带位置差不多,但测序回来都比对不上T T

发自小木虫Android客户端
3楼2017-01-04 15:41:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

MAS_rice

至尊木虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-01-06 07:45:02
能扩出来应该可以用吧,要不然你把这个扩出来的前段连个T载,再测序看看是不是目的前段

发自小木虫Android客户端
竹杖芒鞋轻胜马,谁怕,一蓑烟雨任平生;回首向来萧瑟处,归去,也无风雨也无晴
2楼2017-01-03 23:20:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MAS_rice

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangdie at 2017-01-04 15:41:08
做过了,挑了十个菌都出了结果位置和我目的条带位置差不多,但测序回来都比对不上T T
...

怎么比对不上呢,你用T载的局部序列去比对看看呢

发自小木虫Android客户端
竹杖芒鞋轻胜马,谁怕,一蓑烟雨任平生;回首向来萧瑟处,归去,也无风雨也无晴
4楼2017-01-04 22:12:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangdie

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by MAS_rice at 2017-01-04 22:12:15
怎么比对不上呢,你用T载的局部序列去比对看看呢
...

我比过一次也让师姐比过一次,两个都是什么菌的基因序列,所以我想是不是特异性引物太差根本没克出我要的基因,升高退火温度就几乎没有条带,降低退火还会在500bp左右出现一堆别的条带。。。

发自小木虫Android客户端
5楼2017-01-04 23:09:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +3 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-08 12:22 by 仁砚薪传
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 10:39 by 3OOjAIS77qg2
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 08:59 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见