24小时热门版块排行榜    

查看: 4677  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kim orange

新虫 (初入文坛)

[求助] 周期性边界条件下为什么会出现原子丢失???? 已有2人参与

我做的是Ti-Al-Nb的三元体系,PPP周期性边界条件,只是在NVE系综下做弛豫,结果显示原子丢失(in文件如下图)。针对这种情况,我想问两个问题。
1)周期性边界条件不就是为了保证模拟盒子内的粒子数保持不变么,为什么会出现原子丢失?
2)还有,参考文献中的晶体模型是这样的:有Nb-Ti键和Ti-Ti键(下图);我在MS中建模然后导成data文件,data文件中没有bond信息,只有原子坐标信息。难道是这个原因导致原子丢失么,没有bond的作用,只有pair的相互作用?因为我的单胞晶格常数为a=6.091A,b=9.695A,c=4.706A,里面包含16个原子,就是原子比较密集,原子间距离太小,作用力太大,使原子获得了一个很大的速度,跑出了模拟盒子?
望大家一起交流讨论,谢谢!

周期性边界条件下为什么会出现原子丢失????
in.PNG


周期性边界条件下为什么会出现原子丢失????-1
model.PNG
回复此楼
加油everything!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

csutzk

木虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by brucefan at 2016-12-19 17:51:56
第一,确保体系晶格常数基本正确。第二,做弛豫要用NVT或者NPT系综,不要用NVE系综。第三,尝试减小步长。第四,输出温度,压强,盒子大小等信息,分析结果。
...

弛豫是都不能用NVE?还是说用其他的会好一些?我做了一个关于球摩擦的用的NVE,没什么问题呀?
4楼2016-12-20 10:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

体系不稳定,或者初始构型没有松弛好。
2楼2016-12-19 16:23:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

第一,确保体系晶格常数基本正确。第二,做弛豫要用NVT或者NPT系综,不要用NVE系综。第三,尝试减小步长。第四,输出温度,压强,盒子大小等信息,分析结果。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2016-12-19 17:51:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

一般来说,需要先控温或者控温且控压。达到目标温度和压强后可撤去热浴压浴。一开始就用NVE系综的做法我是没见过。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2016-12-20 17:39:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
请填处理意见