| 查看: 4675 | 回复: 5 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
kim orange新虫 (初入文坛)
|
[求助]
周期性边界条件下为什么会出现原子丢失？？？？ 已有2人参与
|
||
|
我做的是Ti-Al-Nb的三元体系，PPP周期性边界条件，只是在NVE系综下做弛豫，结果显示原子丢失（in文件如下图）。针对这种情况，我想问两个问题。 1）周期性边界条件不就是为了保证模拟盒子内的粒子数保持不变么，为什么会出现原子丢失？ 2）还有，参考文献中的晶体模型是这样的：有Nb-Ti键和Ti-Ti键（下图）；我在MS中建模然后导成data文件，data文件中没有bond信息，只有原子坐标信息。难道是这个原因导致原子丢失么，没有bond的作用，只有pair的相互作用？因为我的单胞晶格常数为a=6.091A,b=9.695A,c=4.706A，里面包含16个原子，就是原子比较密集，原子间距离太小，作用力太大，使原子获得了一个很大的速度，跑出了模拟盒子？ 望大家一起交流讨论，谢谢！  in.PNG  model.PNG |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子动力学模拟 |
» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有19人回复
-
面上合作单位盖章
已经有9人回复
-
面上函评意见出来了，像什么等级？
已经有17人回复
-
为什么国自然不能直接公布
已经有5人回复
-
梦想
已经有7人回复
-
学科评审组评审是指会评吗？
已经有4人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有14人回复
-
小白求助 投论文要求的highlights应该如何写
已经有4人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有12人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有6人回复
csutzk 
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1696.8
- 散金: 67
- 红花: 1
- 帖子: 224
- 在线: 52.1小时
- 虫号: 4858386
- 注册: 2016-07-21
- 性别: GG
- 专业: 微/纳机械系统
4楼2016-12-20 10:32:34
jluchemlib
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 119 (高中生)
- 金币: 11613.4
- 散金: 200
- 红花: 19
- 帖子: 521
- 在线: 356.1小时
- 虫号: 589656
- 注册: 2008-08-30
- 性别: GG
- 专业: 高分子物理与高分子物理化
2楼2016-12-19 16:23:08
brucefan
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +218 - 模拟EPI: 4
- 应助: 422 (硕士)
- 金币: 2294.8
- 散金: 1720
- 红花: 88
- 帖子: 1423
- 在线: 670.2小时
- 虫号: 3048965
- 注册: 2014-03-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 分子模拟
3楼2016-12-19 17:51:56
brucefan
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +218 - 模拟EPI: 4
- 应助: 422 (硕士)
- 金币: 2294.8
- 散金: 1720
- 红花: 88
- 帖子: 1423
- 在线: 670.2小时
- 虫号: 3048965
- 注册: 2014-03-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 分子模拟
5楼2016-12-20 17:39:36
5