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我见过我梦

新虫 (初入文坛)

[求助] 抗体序列分析 已有1人参与

各位虫友好!在下新虫一枚~很想请教个问题
最近刚接触抗体这一块,很想知道我拿到一个未知的抗体基因序列 ,我想知道哪些片段是编码可变区 铰链区 恒定区呀?在线等 真的很急 刚百度了下 无结果……实在不知道用什么软件或方法分析 ……先谢过在此

@biostar2009 发自小木虫IOS客户端
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匿名

用户注销 (著名写手)

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-12-18 23:06:25
本帖仅楼主可见
4楼2016-12-18 21:10:17
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尼摩2012

金虫 (著名写手)

Bioinformatics

【答案】应助回帖

用blast呀,coding区,non-coding区都标好了
你只需在一点上自命不凡!
2楼2016-12-14 23:04:13
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飞雪城飞雪

金虫 (小有名气)

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-12-19 07:42:31
建议IMGT,最大的抗体免费数据库,如果有条件kabat会比较好一些

发自小木虫IOS客户端
5楼2016-12-18 21:31:34
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飞雪城飞雪

金虫 (小有名气)

有时候IMGT比对的轻链CDR区氨基酸就三个,显然不对,RABAT还好吧比较正常,收费是有原因的

发自小木虫IOS客户端
7楼2016-12-19 14:29:52
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普通回帖

sharon2011

新虫 (初入文坛)

你好 我最近也在做抗体方面 也有很多需要学习 如果方便的话留个QQ 我们交流一下
3楼2016-12-18 21:00:29
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匿名

用户注销 (著名写手)

本帖仅楼主可见
6楼2016-12-19 01:15:33
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我见过我梦

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by louis_cheung at 2016-12-18 21:10:17
看看序列就知道了,可变区FR4基序保守,铰链/恒定去同一物种同一亚型固定~~

已解决

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8楼2016-12-25 15:23:33
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我见过我梦

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 飞雪城飞雪 at 2016-12-19 14:29:52
有时候IMGT比对的轻链CDR区氨基酸就三个,显然不对,RABAT还好吧比较正常,收费是有原因的

谢谢指点

发自小木虫IOS客户端
9楼2016-12-25 15:23:48
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sharon2011

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 我见过我梦 at 2016-12-25 15:23:48
谢谢指点
...

你有QQ吗 我们能交流一下抗体方面的问题吗

发自小木虫IOS客户端
10楼2016-12-27 22:00:33
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