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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » HSE天河2号运算出错，卡在了entering main looping
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weiyidan

新虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2016-12-10 21:15:09
当然了。我们这边有的节点专门装了大内存，取名胖节点，不知道你用的有没。另外，跨的节点越多算的越慢，核不不是越多越好，多核并行也是要时间的。...

哇，版主是超算中心的？我现在应该怎么做呢？用胖节点吗？我现在还在试用期间，应该怎么做呢？第一次用超算
1. 增加节点，我现在用的4节点96核
2. 要求管理员开放内存权限
是这两种解决方案吗？
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11楼2016-12-10 21:49:55
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
引用回帖:
11楼: Originally posted by weiyidan at 2016-12-10 21:49:55
哇，版主是超算中心的？我现在应该怎么做呢？用胖节点吗？我现在还在试用期间，应该怎么做呢？第一次用超算
1. 增加节点，我现在用的4节点96核
2. 要求管理员开放内存权限
是这两种解决方案吗？...

我不是超算的，但是我在用超算。
1. 增加节点，我现在用的4节点96核
2. 要求管理员开放内存权限
两种都可以，你也可以减小精度进行计算。
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weiyidan
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
12楼2016-12-10 21:53:11
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weiyidan

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
12楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2016-12-10 21:53:11
我不是超算的，但是我在用超算。
1. 增加节点，我现在用的4节点96核
2. 要求管理员开放内存权限
两种都可以，你也可以减小精度进行计算。...

谢谢
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13楼2016-12-10 21:55:29
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obaica

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weiyidan weiyidan
14楼2016-12-10 22:02:57
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
引用回帖:
14楼: Originally posted by obaica at 2016-12-10 22:02:57
开什么玩笑…  一个HSE06让管理员开放管理员内存权限。

明明是参数和节点cpu设置不合理...

我有说让他减少精度算，另外参数和节点我也有提示，让他自己选择就可以了。再说让管理开个权限也不是啥大问题，我们组的服务器我就包可以的，怎么说也是上百核的小超算
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
15楼2016-12-10 22:15:59
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obaica

禁言 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
16楼2016-12-10 22:21:29
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
引用回帖:
16楼: Originally posted by obaica at 2016-12-10 22:21:29
棒！ 据我所知天河二号比较难申请大内存的权限，除非有非用不可的理由。因为它还有很多不完善的地方。15年才投入使用。它的机时还只能用节点数目来计时，而不能用cpu核数来计时。...

那就不知道了，我们组自己有小超算，学院里有大超算，管理员基本你都见过，还是比较好说话的。天河不太清楚，从来没用过。
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weiyidan weiyidan
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
17楼2016-12-10 22:24:31
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06022043

铁杆木虫 (著名写手)
我用天津超算也经常出现问题，有时候莫名其妙都停了。

发自小木虫Android客户端
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专心做学问
18楼2016-12-10 22:48:31
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weiyidan

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
14楼: Originally posted by obaica at 2016-12-10 22:02:57
开什么玩笑…  一个HSE06让管理员开放管理员内存权限。

明明是参数和节点cpu设置不合理...

那应该怎么办呢？麻烦帮看看，谢谢，降低EDIF精度吗
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19楼2016-12-10 23:07:59
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weiyidan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by obaica at 2016-12-10 22:21:29
棒！ 据我所知天河二号比较难申请大内存的权限，除非有非用不可的理由。因为它还有很多不完善的地方。15年才投入使用。它的机时还只能用节点数目来计时，而不能用cpu核数来计时。...

调整这两个吗 ？
EDIFF = 0.00001
EDIFFG = -0.001
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20楼2016-12-10 23:09:55
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