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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] 仅根据NCBI上的核酸序列能否判断5'端到头了没有? 已有1人参与

仅根据NCBI上的核酸序列能否判断5'端到头了没有?
只有序列信息,没有甲基化信息,能否判断出来5'端到头了没有?
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

up
2楼2016-11-25 14:49:52
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cry_2013

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
应该是可以的吧,NCBI上传的序列多数是全基因,能从第一个碱基开始比对 上应该就是5‘端的头了,我是这么认为的,仅供参考
3楼2016-11-25 16:12:00
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jiananx

铜虫 (小有名气)

看ATG前面有多长,试试根据进化同源性高的物种blast 一下?

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-11-25 22:41:38
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jiananx at 2016-11-25 22:41:38
看ATG前面有多长,试试根据进化同源性高的物种blast 一下?

感谢
5楼2016-11-28 15:46:36
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cry_2013 at 2016-11-25 16:12:00
应该是可以的吧,NCBI上传的序列多数是全基因,能从第一个碱基开始比对 上应该就是5‘端的头了,我是这么认为的,仅供参考

感谢,可是并不能从第一个碱基比对上
6楼2016-11-28 15:47:00
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太阳的电子

新虫 (小有名气)

你说的是指某个基因到头还是序列到头?某个基因序列是否全部还是部分上面有描述的,序列到头那就呵呵呵呵…

发自小木虫Android客户端
7楼2016-11-30 08:09:06
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