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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 电荷密度图求助
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董圣群

新虫 (初入文坛)
我想问一下电荷密度图怎么做

发自小木虫Android客户端
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11楼2017-03-29 20:52:47
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

对于作图：
你这个好像使用 Vesta做的吧。 软件自带的作图，一般都不太漂亮，自定义的少，我一般是将电荷密度的二维数据导出来，用matlab画的，能自定义的东西比较多。
一般具体信息一般是：整个矩阵图形的起点，方向一和方向二的步长向量，两个方向的点数，再加上整个分子中所有原子的坐标，这样你就可以判断哪些原子在图形里面，然后可以计算出位置，画出化学键连接等。

对于从图像中获取的信息；
如果只是做电子密度图，你可以看出电子空间分布，在成键后电子偏移趋势等

我个人一般是做deformation density图，就是用已经得到电子密度减去绝缘的电子密度（中文翻译不太清楚，isolated atom charge density） \rho-\rho(isolated，一般用Clementi模型)，这样能非常清楚的看出电子偏移趋势。

给你贴个例子吧（纯计算的，我给加了自旋，可能结果有点奇怪）
小标题上有等高线的信息，单位等

图片中蓝色为正，表示比原来得到了更多电子，红色为负，表示比成键钱失去了电子（实验那边这么定义的，我也没办法）
电荷密度图求助
Charge_map.jpg
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12楼2017-03-29 22:38:35
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