24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (3034)
>虫友互识 (606)
>休闲灌水 (105)
>基金申请 (91)
>博后之家 (85)
>导师招生 (82)
>论文投稿 (78)
>文献求助 (68)
>教师之家 (44)
>硕博家园 (39)
>考博 (23)
>药学 (19)
>招聘信息布告栏 (13)
>医学 (11)
>公派出国 (10)
>考研 (9)

返回列表

董圣群

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 2.4
帖子: 4
在线: 3.1小时
虫号: 3475519
注册: 2014-10-14
性别: MM
专业: 金属材料的合金相、相变及

我想问一下电荷密度图怎么做

发自小木虫Android客户端

赞一下

回复此楼

11楼2017-03-29 20:52:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

应助: 55 (初中生)
金币: 1944
散金: 221
红花: 11
帖子: 169
在线: 108.2小时
虫号: 6034100
注册: 2017-03-17
性别: GG
专业: 理论和计算化学

【答案】应助回帖

对于作图：
你这个好像使用 Vesta做的吧。软件自带的作图，一般都不太漂亮，自定义的少，我一般是将电荷密度的二维数据导出来，用matlab画的，能自定义的东西比较多。
一般具体信息一般是：整个矩阵图形的起点，方向一和方向二的步长向量，两个方向的点数，再加上整个分子中所有原子的坐标，这样你就可以判断哪些原子在图形里面，然后可以计算出位置，画出化学键连接等。

对于从图像中获取的信息；
如果只是做电子密度图，你可以看出电子空间分布，在成键后电子偏移趋势等

我个人一般是做deformation density图，就是用已经得到电子密度减去绝缘的电子密度（中文翻译不太清楚，isolated atom charge density） \rho-\rho(isolated，一般用Clementi模型)，这样能非常清楚的看出电子偏移趋势。

给你贴个例子吧（纯计算的，我给加了自旋，可能结果有点奇怪）
小标题上有等高线的信息，单位等

图片中蓝色为正，表示比原来得到了更多电子，红色为负，表示比成键钱失去了电子（实验那边这么定义的，我也没办法

）

Charge_map.jpg

赞一下

回复此楼

12楼2017-03-29 22:38:35

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 hexin1982 的主题更新

返回列表