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yakun123

铁虫 (小有名气)

[求助] 重叠pcr问题求大侠赐教已有1人参与

我在做重叠pcr时,遇到了以下问题
1.mark跑出来不是很分散,可能是胶的问题,具体原因不是很清楚,麻烦讲下胶的注意事项
2.扩增杂带多,查资料讲可能是重叠互补的片段与两边的引物退火温度不一致,建议用特异性高的20bp序列作为重叠区,这样会增加引物长度,不会很贵吗?如果可以,大家会这样用吗?
3.pcrw体系配制除了重组酶和buffer都是统一配置分装的,最后有2管没p出来,p出了6管.是我的操作不过关嘛
我做的是三段重叠,分别为500.1200.500bp.新手问题比较多,一样对重叠pcr注意事项讲详细点,谢谢大侠!

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小冀-

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
胶的问题的话重新陪就是了,不行换个浓度试试,引物的话花不了多少钱的

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4楼2016-11-13 12:24:52
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yakun123

铁虫 (小有名气)

补充下,我做的三段都做了纯化,然后按照师兄讲的用片段浓度除以片段长度算出后,定中片段为1微,算出上和下的体积,没有先做10个循环,直接将酶引物都放入做的pcr. 做了四次,第一次成功了,切胶回收没做对。失败了两次,都是没有目的条带,第四次有成功的也有没有的,杂带较多。确定引物酶都没问题

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2楼2016-11-13 10:38:28
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yakun123

铁虫 (小有名气)

上中下片段浓度分别为70.5,147,50  ng/微。加入的量分别为0.84,1,1.175微,是不是加的太多了

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3楼2016-11-13 10:45:06
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yakun123

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小冀- at 2016-11-13 12:24:52
胶的问题的话重新陪就是了,不行换个浓度试试,引物的话花不了多少钱的

你好 ,我加入的量有问题吗,一般加多少,我不是很懂

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5楼2016-11-13 22:52:57
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