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152441153新虫 (初入文坛)
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[求助]
gromacs对水的非平衡MD模拟
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想请教两个问题： 1，在模拟非平衡MD时，文献资料上采用了NVT系综作为分析目的。问题是：在预平衡NVT.mdp和NPT.mdp需要写如( Non-equilibrium MD stuff =)的参数吗？ 2， ; Non-equilibrium MD stuff = acc-grps = Water accelerate =0.1 0.0 0.0 freezegrps = SOL freezedim = Y Y Y cos-acceleration = 0.1 deform =?(怎么填or要不要填) 我采用的是256个水分子模拟，不知道参数这样写对吗? 希望老师们给予指点，带我飞！  |
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