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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 怎么确定5'起始密码子之前UTR长度
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li245824369

木虫 (小有名气)

[求助] 怎么确定5'起始密码子之前UTR长度 已有1人参与

RACE克隆了一个基因，但是不知道怎么确定两端UTR长度，求帮忙，要准确答案！

@biostar2009 发自小木虫Android客户端
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1楼 2016-10-21 08:03:43
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winyuyuyu123

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kuaile5420: 金币+2, 欢迎发帖交流 2016-10-21 19:12:31
kuaile5420: 金币+2, 欢迎发帖交流 2016-10-21 19:18:03
方案1：对于已知的基因，可直接在NCBI上面进行比对，获取你的基因的全部序列信息，在mRNA序列中选择cds序列，两者对比一下即可知道5'和3'UTR序列。
方案2：既然做了RACE，肯定是知道了部分基因序列，分别做5'和3'RACE，用PCR技术或者克隆技术获得cDNA全长，从而确定两端的UTR。
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2楼2016-10-21 11:28:30
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li245824369

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by winyuyuyu123 at 2016-10-21 11:28:30
方案1：对于已知的基因，可直接在NCBI上面进行比对，获取你的基因的全部序列信息，在mRNA序列中选择cds序列，两者对比一下即可知道5'和3'UTR序列。
方案2：既然做了RACE，肯定是知道了部分基因序列，分别做5'和3'R ...

我的是未知基因，测序回来不知道怎么确定UTR长度。。。

发自小木虫Android客户端
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3楼2016-10-21 12:24:01
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