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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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15836073150

金虫 (小有名气)

[求助] 内参基因筛选问题 已有1人参与

最近在做内参基因的筛选,对于normfinder的使用有点疑问。
最近在做内参基因的筛选,对于normfinder的使用有点疑问,以下2种数据输入哪种是正确的:
1、直接输入Ct值,选上log transform data进行分析
2、参考genorm的用法,即在所有PCR结果中找到Ct值最低的,所有其他数据以2^-δCT计算相对表达量,然后再将相对表达量的数据输入后用normfinder分析,此时不选log transform data
我用这2种方法都试过,但结果不一样。请问哪种方法是对的,或者二者都不对,正确的应该怎么使用,望高手解惑,不胜感激!!!
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liushunyi1

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-01-23 21:39:34
应该都可以吧,但我没用过,说明中是这样写的:The data are supposed to be on a linear scale. If your data are already log transformed (natural base (e) logarithm) this is acceptable too, if you uncheck the field “log transformed data”
5楼2017-01-18 10:30:53
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Ivy尘

新虫 (正式写手)

楼主,能不能发一份normfinder?我之前下载的打不开,不造为什么。。。
3楼2016-12-05 15:59:22
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29在路上

银虫 (小有名气)

楼主 我也要做内参筛选,可以发我这两个软件么
熬得住,出众;熬不住,出局
6楼2017-01-23 16:30:42
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王慕阮

新虫 (初入文坛)

楼主,你解决了吗?我也是发生了这样的情况,不知道改选择哪一种

发自小木虫IOS客户端
7楼2017-03-23 01:51:53
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